More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0231 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0231  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3229  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.03 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  35.34 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1268  RNA methyltransferase  35.5 
 
 		 262 aa  119  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  34.91 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  34.91 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  36.82 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2624  RNA methyltransferase  33.19 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1646  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.6 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  35.34 
 
 		 287 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  31.76 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.36 
 
 		 259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0828  RNA methyltransferase  31.36 
 
 		 275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.23 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  31.78 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  31.78 
 
 		 291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 276 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0441  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.83 
 
 		 248 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  33.76 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  33.76 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  31.09 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  32.64 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  31.38 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  33.76 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  32.23 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  32.89 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1795  RNA methyltransferase  34.05 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.313918  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.48 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  33.48 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  32.78 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1620  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.71 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  33.48 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.31 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.75 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  29.41 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  33.48 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0463  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.51 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.74203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.63 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  33.19 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.2 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  32.92 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  32.23 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2281  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.77 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.19 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0682  putative RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000176803  normal  0.146747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.2 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.76 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  31.76 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  32.61 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0941  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.92 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.19 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  31.06 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.05 
 
 		 263 aa  101  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1571  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.51 
 
 		 258 aa  101  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.17 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.83 
 
 		 264 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.75 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.17 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.76 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2949  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.91 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  33.62 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4570  RNA methyltransferase  34.47 
 
 		 298 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0223529  normal  0.0756262 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  30.96 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.3 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3864  putative RNA methyltransferase  32.17 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000175162  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  31.54 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2517  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.24 
 
 		 353 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127237  hitchhiker  0.00000580733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.93 
 
 		 254 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1133  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.16 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  32.46 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  32.46 
 
 		 263 aa  99.4  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1245  RNA methyltransferase  34.35 
 
 		 260 aa  99.4  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01053  rRNA methylase  29.51 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0571  putative RNA methyltransferase  32.97 
 
 		 232 aa  99.4  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.918985  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  32.49 
 
 		 250 aa  99  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  32.07 
 
 		 241 aa  99  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3670  putative RNA methyltransferase  32.14 
 
 		 228 aa  98.6  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  30.64 
 
 		 286 aa  98.6  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.76 
 
 		 254 aa  98.2  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2062  tRNA/rRNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.07 
 
 		 247 aa  97.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.92 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2103  RNA methyltransferase  32.19 
 
 		 289 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247201 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.61 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0420  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.91 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.674451  normal  0.0345812 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  32.22 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  30.21 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  32.22 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  33.48 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  31.47 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  31.74 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  30.12 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  32.22 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0569  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.75 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0788  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.77 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0987211  normal  0.0803398 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.47 
 
 		 271 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.277848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.88 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  32.07 
 
 		 261 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1935  RNA methyltransferase  31.03 
 
 		 338 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136994  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.5 
 
 		 399 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  30.71 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>