74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8838 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  100 
 
 		 609 aa  1223    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  38.87 
 
 		 627 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  45.09 
 
 		 661 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  44.59 
 
 		 678 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  41.58 
 
 		 688 aa  213  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.11 
 
 		 624 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  43.4 
 
 		 656 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  41.91 
 
 		 673 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  43.92 
 
 		 714 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  40.91 
 
 		 1037 aa  178  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  41.48 
 
 		 635 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  42.15 
 
 		 667 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  40.84 
 
 		 442 aa  170  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  39.12 
 
 		 589 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.46 
 
 		 871 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  39.51 
 
 		 1073 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2569  FG-GAP repeat protein  38.83 
 
 		 685 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  40.19 
 
 		 635 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.61 
 
 		 1412 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  38.66 
 
 		 663 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  38.84 
 
 		 905 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.22 
 
 		 847 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.65 
 
 		 464 aa  154  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.45 
 
 		 386 aa  153  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.82 
 
 		 684 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  37.57 
 
 		 848 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4330  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 485 aa  147  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  36.91 
 
 		 554 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  37.75 
 
 		 643 aa  147  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  36.9 
 
 		 1192 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  35.35 
 
 		 976 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8845  hypothetical protein  40.43 
 
 		 371 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5044  hypothetical protein  42.37 
 
 		 769 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  35.58 
 
 		 998 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.16 
 
 		 885 aa  141  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  38.03 
 
 		 682 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  35.66 
 
 		 841 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  29.7 
 
 		 600 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  32.45 
 
 		 1550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.43 
 
 		 600 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.34 
 
 		 448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  31.79 
 
 		 688 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.7 
 
 		 719 aa  117  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4450  hypothetical protein  36.68 
 
 		 421 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385348  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  29.95 
 
 		 1452 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.84 
 
 		 860 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.27 
 
 		 706 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.11 
 
 		 2884 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.14 
 
 		 769 aa  106  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.3 
 
 		 510 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  28.83 
 
 		 640 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  27.05 
 
 		 600 aa  98.6  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.94 
 
 		 543 aa  98.6  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  29.38 
 
 		 1312 aa  97.8  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.45 
 
 		 1045 aa  97.4  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.85 
 
 		 530 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.04 
 
 		 326 aa  94.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.6 
 
 		 619 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  26.67 
 
 		 570 aa  88.6  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  26.42 
 
 		 538 aa  87.8  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  28.7 
 
 		 637 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  28.29 
 
 		 962 aa  85.1  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.04 
 
 		 795 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.23 
 
 		 600 aa  82.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36 
 
 		 475 aa  80.1  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.66 
 
 		 649 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  30.61 
 
 		 833 aa  77.8  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.59 
 
 		 749 aa  75.1  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.36 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.41 
 
 		 1059 aa  68.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  27.4 
 
 		 1916 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  31.86 
 
 		 297 aa  54.7  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.14 
 
 		 1135 aa  49.7  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  33.33 
 
 		 551 aa  47.4  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>