14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5044 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5044  hypothetical protein  100 
 
 		 769 aa  1521    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5049  CHAP domain containing protein  90.49 
 
 		 562 aa  588  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2569  FG-GAP repeat protein  41.11 
 
 		 685 aa  296  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8845  hypothetical protein  35.38 
 
 		 371 aa  221  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4450  hypothetical protein  36.09 
 
 		 421 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385348  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  42.15 
 
 		 609 aa  175  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4330  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.32 
 
 		 485 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  36.47 
 
 		 627 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0456  hypothetical protein  24.31 
 
 		 2764 aa  62.8  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.000000000000873422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  25.67 
 
 		 1363 aa  57.4  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  21.59 
 
 		 1093 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  23.28 
 
 		 1086 aa  51.2  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  27.65 
 
 		 6276 aa  50.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  24.32 
 
 		 492 aa  44.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>