74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8288 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  100 
 
 		 627 aa  1251    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  39.36 
 
 		 609 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  47.77 
 
 		 635 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  47.13 
 
 		 714 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  44.41 
 
 		 678 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.52 
 
 		 624 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  43.21 
 
 		 673 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  44.28 
 
 		 656 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  47.62 
 
 		 661 aa  183  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  42.03 
 
 		 688 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  41.49 
 
 		 847 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  40.96 
 
 		 871 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  42.17 
 
 		 1073 aa  160  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  40.76 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.97 
 
 		 386 aa  157  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  40.98 
 
 		 663 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  42.51 
 
 		 635 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  35.73 
 
 		 589 aa  147  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.87 
 
 		 885 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.6 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  35.83 
 
 		 848 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.23 
 
 		 684 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.98 
 
 		 719 aa  144  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  37.39 
 
 		 998 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  37.74 
 
 		 554 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  39.33 
 
 		 1037 aa  144  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  38.67 
 
 		 976 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.23 
 
 		 600 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.12 
 
 		 1412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  36.81 
 
 		 667 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  37.68 
 
 		 643 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  36.14 
 
 		 1192 aa  121  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.93 
 
 		 905 aa  120  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  35.35 
 
 		 510 aa  118  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  40.47 
 
 		 682 aa  118  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2569  FG-GAP repeat protein  30.61 
 
 		 685 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.81 
 
 		 706 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  32.85 
 
 		 962 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.72 
 
 		 860 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  37.42 
 
 		 841 aa  112  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.33 
 
 		 619 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5044  hypothetical protein  35.89 
 
 		 769 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.22 
 
 		 448 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.7 
 
 		 543 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  31.53 
 
 		 1045 aa  100  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  29.88 
 
 		 688 aa  97.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  29.89 
 
 		 1312 aa  95.9  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8845  hypothetical protein  35.5 
 
 		 371 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  28.65 
 
 		 538 aa  93.6  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  24.93 
 
 		 600 aa  90.5  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.05 
 
 		 769 aa  90.1  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  25.76 
 
 		 570 aa  89.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.3 
 
 		 326 aa  87.8  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  26.06 
 
 		 640 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.79 
 
 		 2884 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  27.22 
 
 		 1550 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  25.22 
 
 		 600 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  25.18 
 
 		 1452 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  27.25 
 
 		 637 aa  82  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.79 
 
 		 795 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.89 
 
 		 649 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4330  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.98 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.24 
 
 		 600 aa  74.3  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.39 
 
 		 530 aa  69.7  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.87 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4450  hypothetical protein  31.25 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385348  normal  0.238921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.27 
 
 		 342 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2871  hypothetical protein  32.4 
 
 		 290 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.926327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.19 
 
 		 749 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  28.35 
 
 		 833 aa  54.7  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  34.05 
 
 		 297 aa  54.3  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0821  cell wall-binding domain-containing protein  28.16 
 
 		 330 aa  50.8  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0103  hypothetical protein  34.27 
 
 		 370 aa  48.9  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  27.65 
 
 		 1916 aa  44.3  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>