128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7746 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  388  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  48.72 
 
 		 193 aa  167  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  46.67 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  43.68 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  41.97 
 
 		 194 aa  114  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.46 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  42.71 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.94 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.16 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  40.15 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  36.17 
 
 		 222 aa  85.1  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.06 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.64 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.06 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.52 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.73 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.11 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.68 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.34 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.11 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8364  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.67 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  30.21 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.59 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.67 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  26.73 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  35.43 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.82 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5058  deaminase-reductase domain-containing protein  27.05 
 
 		 215 aa  64.3  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3914  bifunctional deaminase-reductase-like  31.61 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  32.77 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4054  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.51 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.42 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.7 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4020  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.61 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  28.92 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.38 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.38 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.4 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0378  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00950  dihydrofolate reductase  29.81 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.73 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0240  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  32.81 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.51 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.6 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  30.05 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.74 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.06 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  29.59 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  29.59 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6197  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.29 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  26.88 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  24.74 
 
 		 173 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.28 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3337  DNA-binding protein  34.27 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3399  DNA-binding protein  34.27 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3348  DNA-binding protein  34.27 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.08465  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.45 
 
 		 178 aa  51.6  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1876  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.91 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  24.74 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2571  deaminase-reductase domain-containing protein  30.57 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.5 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  24.74 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1818  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.64 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450783  hitchhiker  0.00922336 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  32.17 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0446  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  28.36 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0510  deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.120308  normal  0.164935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4615  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  29.17 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.57 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3505  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.11 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000551807  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  25.49 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  23.68 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0541  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.6 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.932074 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  24.74 
 
 		 174 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2224  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.96 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  25.62 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  28.31 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  28.66 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.45 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02020  dihydrofolate reductase  32 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.68 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4493  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.29 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  28.34 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.09 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2668  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6643  deaminase-reductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  24.1 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.27 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.74 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  26.46 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  24.35 
 
 		 174 aa  45.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  23.08 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1051  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 218 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0782289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  30 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>