41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0446 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0446  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  100 
 
 		 221 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1048  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  45.98 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1843  deaminase-reductase domain-containing protein  37.84 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.53223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.11 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1915  deaminase-reductase domain-containing protein  27.75 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.94 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62458 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8339  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.41 
 
 		 240 aa  62  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03960  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  27.08 
 
 		 246 aa  62  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3284  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.24 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6142  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.87 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.23 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.650924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3358  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.04 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6709  Pyrimidine reductase riboflavin biosynthesis- like protein  31.58 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4269  deaminase-reductase domain-containing protein  26.81 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.784673  normal  0.386339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2883  deaminase-reductase domain-containing protein  27.12 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154582  normal  0.528323 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0643  hypothetical protein  32.5 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4398  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.47 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0716  putative pyrimidine reductase  24.47 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.75 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  28.36 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.62 
 
 		 178 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1549  riboflavin biosynthesis protein RibD  32 
 
 		 365 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0908  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000531034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1255  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.38 
 
 		 384 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3920  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.13 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0664  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.81 
 
 		 370 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.304545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3492  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.37 
 
 		 376 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1398  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  32.5 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0937  2, 5-diamino-6-(5-phosphoribosylamino)pyrimidin-4(3H)-one reductase  26.98 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0807982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  40.74 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.84 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.71 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0020  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.73 
 
 		 360 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0593  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25 
 
 		 360 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.075481  normal  0.240855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1316  hypothetical protein  30 
 
 		 257 aa  42.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0708  riboflavin biosynthesis protein RibD  27.68 
 
 		 370 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.101986  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2926  riboflavin biosynthesis protein RibD  27.45 
 
 		 392 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2834  riboflavin biosynthesis protein RibD  27.45 
 
 		 392 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0554952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  34.88 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.15 
 
 		 204 aa  42  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0416  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  28.86 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>