61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6142 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6142  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  100 
 
 		 239 aa  473  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8339  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  70.17 
 
 		 240 aa  330  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2727  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  43.03 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  0.18578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2883  deaminase-reductase domain-containing protein  47.48 
 
 		 244 aa  181  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154582  normal  0.528323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4269  deaminase-reductase domain-containing protein  44.12 
 
 		 238 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.784673  normal  0.386339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.12 
 
 		 238 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.650924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.46 
 
 		 238 aa  175  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.7 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0716  putative pyrimidine reductase  40.85 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4398  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.85 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3284  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.77 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3358  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.08 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3920  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  35.39 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1915  deaminase-reductase domain-containing protein  32.5 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03960  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  32.24 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.78 
 
 		 297 aa  92.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1843  deaminase-reductase domain-containing protein  29.84 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.53223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1919  hypothetical protein  43.33 
 
 		 84 aa  67.8  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1048  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  26.45 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0446  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  29.87 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0230  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  33.33 
 
 		 360 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0593  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  33.33 
 
 		 360 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.075481  normal  0.240855 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1325  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  33.33 
 
 		 360 aa  52.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.264081  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1398  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  36.78 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0021  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  45.16 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00371896 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0416  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  30.36 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.12 
 
 		 289 aa  48.5  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0584067  normal  0.0428957 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2416  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  33.04 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.189803 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5200  2,5-diamino-6-hydroxy-4-(5- phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  37.04 
 
 		 220 aa  48.9  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.63994  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0604  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  32.32 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0660  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.25 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00276533  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07090  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase /5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  41.89 
 
 		 371 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.312982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6709  Pyrimidine reductase riboflavin biosynthesis- like protein  41.33 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1122  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  35.71 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.858422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0807  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  37.5 
 
 		 226 aa  45.4  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185302  normal  0.290078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3599  5-amino-6-(5- phosphoribosylamino)uracilreductase  29.23 
 
 		 319 aa  45.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0908  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  36.11 
 
 		 226 aa  45.4  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000531034 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0996  bifunctional deaminase-reductase domain protein  23.19 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2731  riboflavin biosynthesis protein RibD  42.62 
 
 		 401 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3078  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  35.29 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.62381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0770  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.25 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1445  riboflavin biosynthesis protein RibD  43.86 
 
 		 371 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09990  riboflavin biosynthesis protein RibD  40.82 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2094  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.33 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0727  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.27 
 
 		 366 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2926  riboflavin biosynthesis protein RibD  44.26 
 
 		 392 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1619  riboflavin biosynthesis protein RibD  37.97 
 
 		 385 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4050  riboflavin biosynthesis protein RibD  40.85 
 
 		 384 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2742  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  44.26 
 
 		 392 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2834  riboflavin biosynthesis protein RibD  44.26 
 
 		 392 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0554952  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0643  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0818  riboflavin biosynthesis protein RibD  38.1 
 
 		 398 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.115621  normal  0.507066 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1890  riboflavin biosynthesis protein RibD  25.3 
 
 		 366 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.22105  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2620  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.52 
 
 		 364 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.146341  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1352  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  37.93 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0644907 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0543  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.4 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0940433  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.47 
 
 		 187 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2385  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.17 
 
 		 368 aa  42.4  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.811979  hitchhiker  0.00228215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00060  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase /5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  45.45 
 
 		 355 aa  42  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.168249  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0876  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.97 
 
 		 239 aa  41.6  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.225628  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0659  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  24.63 
 
 		 357 aa  42  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>