76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0207 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 297 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1843  deaminase-reductase domain-containing protein  46.82 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.53223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1915  deaminase-reductase domain-containing protein  29.53 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3284  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.46 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2883  deaminase-reductase domain-containing protein  33.07 
 
 		 244 aa  99  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154582  normal  0.528323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3358  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 246 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2727  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.5 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  0.18578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6142  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  32.45 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.31 
 
 		 238 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.650924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3920  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.52 
 
 		 240 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4269  deaminase-reductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.784673  normal  0.386339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.52 
 
 		 238 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62458 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03960  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  34.25 
 
 		 246 aa  86.3  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4398  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.16 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0716  putative pyrimidine reductase  31.16 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.06 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8339  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  34.01 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0446  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  33.11 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1048  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  30.23 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0604  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  31.89 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1919  hypothetical protein  40.96 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2416  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  40.35 
 
 		 223 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.189803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2026  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.86 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1398  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  28.02 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0230  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.22 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0593  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  26.58 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.075481  normal  0.240855 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1325  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25.16 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.264081  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1856  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.79 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2257  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  43.75 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.196286 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0807  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  34.07 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185302  normal  0.290078 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0908  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  32.22 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000531034 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0543  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  40.5 
 
 		 220 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0940433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6709  Pyrimidine reductase riboflavin biosynthesis- like protein  42.27 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0643  hypothetical protein  29.25 
 
 		 225 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3078  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  41.57 
 
 		 220 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.62381  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0659  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  24.02 
 
 		 357 aa  53.9  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2575  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.46 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0489  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  35.56 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4689  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.44 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0804  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.73 
 
 		 226 aa  53.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.301306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2094  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.44 
 
 		 234 aa  52.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0226  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  30.19 
 
 		 221 aa  52.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000414817  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0660  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.43 
 
 		 247 aa  52.4  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00276533  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1951  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.86 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5200  2,5-diamino-6-hydroxy-4-(5- phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  41.41 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.63994  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0067  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  28.3 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.679825  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1181  bifunctional deaminase-reductase-like  44.68 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1829  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.78 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0951762  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0416  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  22.62 
 
 		 217 aa  49.3  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1915  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  28.12 
 
 		 377 aa  49.3  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00125058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08530  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase;5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  28.23 
 
 		 371 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3024  riboflavin biosynthesis protein RibD  36.75 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0835  ribD C-terminal domain protein  34.04 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5167  hypothetical protein  40.21 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0937  2, 5-diamino-6-(5-phosphoribosylamino)pyrimidin-4(3H)-one reductase  31.03 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0807982 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2352  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.17 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000292677  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1313  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.24 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1549  riboflavin biosynthesis protein RibD  38.24 
 
 		 365 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23990  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  37.82 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.649981  normal  0.0513609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5288  deaminase-reductase domain-containing protein  46.84 
 
 		 252 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122038  normal  0.871149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1226  riboflavin biosynthesis protein RibD  38.83 
 
 		 369 aa  45.8  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.078845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 289 aa  45.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0584067  normal  0.0428957 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0996  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.66 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1596  riboflavin biosynthesis protein RibD  27.61 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393826  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1445  riboflavin biosynthesis protein RibD  41.94 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0006  riboflavin biosynthesis protein RibD  37.97 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1016  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase., 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  28.94 
 
 		 378 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3108  riboflavin biosynthesis protein RibD  48.33 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04401  riboflavin biosynthesis protein RibD  41.11 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.607399  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1555  hypothetical protein  41.49 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2279  deaminase-reductase domain-containing protein  35.92 
 
 		 419 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296418  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0451  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  41.05 
 
 		 236 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00233078  normal  0.376483 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1908  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase, 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  28.02 
 
 		 364 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1619  riboflavin biosynthesis protein RibD  42.37 
 
 		 385 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1122  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.46 
 
 		 217 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.858422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2570  deaminase-reductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 230 aa  42.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000741328 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>