54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1915 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1915  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1919  hypothetical protein  96.43 
 
 		 84 aa  164  9e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4398  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.05 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0716  putative pyrimidine reductase  37.67 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.77 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.650924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3284  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.27 
 
 		 245 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.75 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4269  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.784673  normal  0.386339 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3358  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.38 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2727  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.72 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  0.18578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3920  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  32.92 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2883  deaminase-reductase domain-containing protein  30.34 
 
 		 244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154582  normal  0.528323 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8339  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.08 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6142  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  32.5 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.95 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.74 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1843  deaminase-reductase domain-containing protein  27.69 
 
 		 329 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.53223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03960  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  27.43 
 
 		 246 aa  95.1  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0446  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  27.75 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1048  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  28.5 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0660  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  38.32 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00276533  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0643  hypothetical protein  32.63 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0604  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  23.11 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0804  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  36.59 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.301306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0937  2, 5-diamino-6-(5-phosphoribosylamino)pyrimidin-4(3H)-one reductase  25.75 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0807982 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5200  2,5-diamino-6-hydroxy-4-(5- phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  24.57 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.63994  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2416  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.03 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.189803 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0908  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  32.29 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000531034 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0996  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.89 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0543  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.36 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0940433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2352  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000292677  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0226  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  31.25 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000414817  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0103  riboflavin-specific deaminase  23.76 
 
 		 396 aa  50.4  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0416  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  24.45 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0451  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  37.21 
 
 		 236 aa  48.5  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00233078  normal  0.376483 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3078  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  31.68 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.62381  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1398  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.17 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0489  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  23.3 
 
 		 232 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4050  riboflavin biosynthesis protein RibD  37.31 
 
 		 384 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2575  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  36.56 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2094  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.14 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0593  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  28.3 
 
 		 360 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.075481  normal  0.240855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  28.4 
 
 		 798 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1559  riboflavin biosynthesis protein RibD  25.41 
 
 		 369 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.855984  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.67 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23590  Peptidase S16, ATP-dependent protease  28.57 
 
 		 797 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0230  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  28.3 
 
 		 360 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1829  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.69 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0951762  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2302  ATP-dependent protease La  31.3 
 
 		 798 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235792  hitchhiker  0.000494744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5019  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  23.74 
 
 		 376 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5167  hypothetical protein  29.84 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0544  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.05 
 
 		 230 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3096  riboflavin biosynthesis protein; diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  26.19 
 
 		 367 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5288  deaminase-reductase domain-containing protein  36.45 
 
 		 252 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122038  normal  0.871149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>