90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1228 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 234 aa  463  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6142  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  43.7 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2727  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  40.08 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  0.18578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2883  deaminase-reductase domain-containing protein  41.15 
 
 		 244 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154582  normal  0.528323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3358  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.42 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3284  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.48 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4398  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.93 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8339  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  38.75 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0716  putative pyrimidine reductase  34.63 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.15 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.650924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4269  deaminase-reductase domain-containing protein  38.98 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.784673  normal  0.386339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.15 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3920  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  35.56 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1915  deaminase-reductase domain-containing protein  29.74 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03960  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  31.02 
 
 		 246 aa  91.7  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1843  deaminase-reductase domain-containing protein  27.52 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.53223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.68 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1048  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  24.15 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0643  hypothetical protein  30.83 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1742  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  35.71 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0665302 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0226  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  26.64 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000414817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3851  riboflavin biosynthesis protein  26.52 
 
 		 370 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3865  riboflavin biosynthesis protein  26.52 
 
 		 370 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3941  riboflavin biosynthesis protein RibD  25.54 
 
 		 370 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1398  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  33.33 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2812  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  28.45 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1122  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.77 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.858422 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0385  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  32.28 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.216591 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4133  riboflavin biosynthesis protein RibD  26.09 
 
 		 370 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.889423 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1352  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  32.74 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0644907 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4331  riboflavin biosynthesis protein RibD  26.09 
 
 		 370 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4018  riboflavin biosynthesis protein RibD  26.09 
 
 		 370 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2834  riboflavin biosynthesis protein RibD  41.56 
 
 		 392 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0554952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2742  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  41.56 
 
 		 392 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1919  hypothetical protein  39.08 
 
 		 84 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2926  riboflavin biosynthesis protein RibD  41.56 
 
 		 392 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4243  riboflavin biosynthesis protein RibD  25.65 
 
 		 370 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0604  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  33.33 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0908  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.2 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000531034 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0446  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  24.75 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.23 
 
 		 190 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1181  bifunctional deaminase-reductase-like  30.8 
 
 		 283 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2094  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.9 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0021  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25.13 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00371896 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1017  riboflavin biosynthesis protein RibD  25.22 
 
 		 370 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5288  deaminase-reductase domain-containing protein  44 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122038  normal  0.871149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3024  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.32 
 
 		 369 aa  48.5  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2575  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  28.37 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1683  deaminase-reductase domain-containing protein  29.19 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.137585  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.11 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4220  riboflavin biosynthesis protein RibD  24.78 
 
 		 370 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6709  Pyrimidine reductase riboflavin biosynthesis- like protein  32.87 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0319  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.68 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  40 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.63 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00060  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase /5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  46.77 
 
 		 355 aa  46.2  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.168249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1226  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.91 
 
 		 369 aa  45.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.078845 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1313  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.87 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4179  riboflavin biosynthesis protein RibD  24.78 
 
 		 370 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2437  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.33 
 
 		 373 aa  45.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1669  riboflavin biosynthesis protein RibD  36.89 
 
 		 373 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.04431e-16 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0804  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.88 
 
 		 226 aa  45.4  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.301306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1445  riboflavin biosynthesis protein RibD  40.68 
 
 		 371 aa  45.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4050  riboflavin biosynthesis protein RibD  37.23 
 
 		 384 aa  45.4  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004265  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  33.73 
 
 		 375 aa  45.4  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000582374  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0996  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.14 
 
 		 241 aa  45.4  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2037  deaminase-reductase domain-containing protein  43.75 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  37.93 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2570  deaminase-reductase domain-containing protein  41.94 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000741328 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2352  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.62 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000292677  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2731  riboflavin biosynthesis protein RibD  38.96 
 
 		 401 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.89 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1816  riboflavin biosynthesis protein RibD  37.78 
 
 		 383 aa  42.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162198  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  34.91 
 
 		 167 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1674  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  38.61 
 
 		 386 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4689  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.36 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2636  riboflavin biosynthesis protein RibD  39.44 
 
 		 389 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.152876  normal  0.370836 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2239  riboflavin biosynthesis protein RibD  27.1 
 
 		 361 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.925938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  35.11 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0770  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.93 
 
 		 234 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.11 
 
 		 185 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.11 
 
 		 187 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.67 
 
 		 176 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.96 
 
 		 230 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00173437  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0660  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30 
 
 		 247 aa  42  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00276533  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1674  deaminase-reductase domain-containing protein  43.48 
 
 		 288 aa  42  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4551  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  40 
 
 		 215 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0543  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.05 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0940433  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1179  riboflavin biosynthesis protein RibD  39.76 
 
 		 404 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403789  normal  0.30811 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4064  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  30.64 
 
 		 373 aa  41.6  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>