81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0716 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0716  putative pyrimidine reductase  100 
 
 		 225 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4398  bifunctional deaminase-reductase domain protein  93.78 
 
 		 225 aa  433  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3284  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.64 
 
 		 245 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3358  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.82 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2727  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  40.89 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  0.18578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2883  deaminase-reductase domain-containing protein  38.6 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154582  normal  0.528323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6142  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  40.85 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8339  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  38.98 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.63 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.07 
 
 		 238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.5 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.650924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4269  deaminase-reductase domain-containing protein  34.07 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.784673  normal  0.386339 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1915  deaminase-reductase domain-containing protein  37.67 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3920  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  33.9 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03960  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  28.57 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.16 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1843  deaminase-reductase domain-containing protein  27.97 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.53223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1919  hypothetical protein  41.46 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1181  bifunctional deaminase-reductase-like  33.7 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1398  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  32.53 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1345  hypothetical protein  27.2 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0908  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  32.53 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000531034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2570  deaminase-reductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000741328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3857  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  33.71 
 
 		 371 aa  52  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1619  riboflavin biosynthesis protein RibD  25.6 
 
 		 385 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5288  deaminase-reductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122038  normal  0.871149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2926  riboflavin biosynthesis protein RibD  48.15 
 
 		 392 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2834  riboflavin biosynthesis protein RibD  48.15 
 
 		 392 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0554952  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0643  hypothetical protein  28.89 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0604  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  25.33 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2742  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  48.15 
 
 		 392 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0446  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  24.47 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0226  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  32.58 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000414817  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1848  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.96 
 
 		 364 aa  48.5  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0876  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.1 
 
 		 239 aa  48.5  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.225628  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0944  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  46.15 
 
 		 366 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1829  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.29 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0951762  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1908  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase, 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.96 
 
 		 364 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0996  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.78 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1010  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.94 
 
 		 377 aa  47  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0593  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  20.3 
 
 		 360 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.075481  normal  0.240855 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0937  2, 5-diamino-6-(5-phosphoribosylamino)pyrimidin-4(3H)-one reductase  32.35 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0807982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1816  riboflavin biosynthesis protein RibD  50 
 
 		 383 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162198  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3555  riboflavin biosynthesis protein RibD  35.16 
 
 		 377 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.49964  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04401  riboflavin biosynthesis protein RibD  35.23 
 
 		 369 aa  46.2  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.607399  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0727  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.35 
 
 		 366 aa  45.8  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2416  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.63 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.189803 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2385  riboflavin biosynthesis protein RibD  42.59 
 
 		 368 aa  45.4  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.811979  hitchhiker  0.00228215 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0659  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  20.69 
 
 		 357 aa  45.1  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4050  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.87 
 
 		 384 aa  45.1  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2093  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.66 
 
 		 376 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0587907  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0251  bifunctional deaminase-reductase domain protein  22.92 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.04862  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2459  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.35 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.033836  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0770  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2945  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  34.38 
 
 		 377 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.308667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0230  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  20.79 
 
 		 360 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0623  riboflavin biosynthesis protein RibD  26.83 
 
 		 372 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000156623  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1325  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  19.02 
 
 		 360 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.264081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4278  riboflavin biosynthesis protein RibD  35.37 
 
 		 383 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23466  normal  0.0329516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2094  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1500  hypothetical protein  31.91 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0067  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25.84 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.679825  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0385  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  26.13 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.216591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1555  hypothetical protein  31.65 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0804  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  26.85 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.301306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1559  riboflavin biosynthesis protein RibD  36.84 
 
 		 369 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.855984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1890  riboflavin biosynthesis protein RibD  24.74 
 
 		 366 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.22105  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0319  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.77 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1725  riboflavin biosynthesis protein RibD  48.84 
 
 		 387 aa  42.4  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.214357  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2731  riboflavin biosynthesis protein RibD  40.74 
 
 		 401 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1352  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.29 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0644907 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0807  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.51 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185302  normal  0.290078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1771  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.99 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1236  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.88 
 
 		 251 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.515775  normal  0.0776685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0835  ribD C-terminal domain protein  27.27 
 
 		 224 aa  42  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2342  bifunctional deaminase-reductase-like  25.9 
 
 		 295 aa  42  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0699059  normal  0.0703576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5167  hypothetical protein  31.65 
 
 		 270 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2279  deaminase-reductase domain-containing protein  33.96 
 
 		 419 aa  41.6  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296418  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4551  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0544  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.55 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>