60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2342 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2342  bifunctional deaminase-reductase-like  100 
 
 
295 aa  598  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0699059  normal  0.0703576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.12 
 
 
289 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0584067  normal  0.0428957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4689  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.5 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1964  hypothetical protein  36.59 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12686  hypothetical protein  30.05 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115861  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16600  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  32.68 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3543  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.58 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000220763  hitchhiker  0.00713021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4028  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.5 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19200  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  29.39 
 
 
321 aa  63.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.203382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0996  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.88 
 
 
241 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23990  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  34.01 
 
 
258 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.649981  normal  0.0513609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1580  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.99 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1500  hypothetical protein  29.96 
 
 
248 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1430  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.34 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0976803  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1555  hypothetical protein  31.66 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1345  hypothetical protein  30.73 
 
 
273 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14870  pyrimidine reductase-like protein  30.22 
 
 
263 aa  59.7  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.47 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.421498  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4752  hypothetical protein  32.93 
 
 
234 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2265  hypothetical protein  29.75 
 
 
257 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425548  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2219  hypothetical protein  29.75 
 
 
257 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2208  hypothetical protein  29.75 
 
 
257 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.579868  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1770  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.96 
 
 
240 aa  55.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15570  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  31.28 
 
 
229 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.154279  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3913  hypothetical protein  28.5 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028814  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1683  deaminase-reductase domain-containing protein  28.43 
 
 
231 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.137585  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2397  deaminase-reductase domain-containing protein  28.95 
 
 
412 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2279  deaminase-reductase domain-containing protein  28.97 
 
 
419 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296418  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5288  deaminase-reductase domain-containing protein  26.74 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122038  normal  0.871149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4013  deaminase-reductase domain-containing protein  28.21 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594838  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1389  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.92 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0920173  normal  0.1343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04401  riboflavin biosynthesis protein RibD  30 
 
 
369 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.607399  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1771  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1236  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.515775  normal  0.0776685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2490  hypothetical protein  27.4 
 
 
264 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.380096 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47432  predicted protein  27 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2352  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  26.94 
 
 
226 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000292677  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2257  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  47.46 
 
 
240 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7389  hypothetical protein  27.84 
 
 
258 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0300  riboflavin biosynthesis protein RibD  30 
 
 
383 aa  46.6  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.820157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0843  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.1 
 
 
363 aa  46.2  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0375  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.84 
 
 
369 aa  46.2  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.989809  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_002978  WD0710  riboflavin biosynthesis protein RibD  25.25 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2821  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.65 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2026  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  26.74 
 
 
226 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1375  deaminase-reductase domain-containing protein  31.47 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.653652  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1400  riboflavin biosynthesis protein RibD  25.1 
 
 
391 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.43118  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1848  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.74 
 
 
364 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2575  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.96 
 
 
221 aa  43.9  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1313  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.47 
 
 
231 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1908  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase, 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  28.74 
 
 
364 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5167  hypothetical protein  30.15 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197252  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1122  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  26.26 
 
 
217 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.858422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3274  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.7 
 
 
367 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0183291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0803  bifunctional deaminase-reductase-like  25.94 
 
 
227 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1316  hypothetical protein  42.37 
 
 
257 aa  42.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0006  riboflavin biosynthesis protein RibD  27.06 
 
 
366 aa  42.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1559  riboflavin biosynthesis protein RibD  27.4 
 
 
369 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.855984  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1742  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  26.54 
 
 
217 aa  42.4  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0665302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>