55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0749 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 221 aa  427  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3543  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.76 
 
 		 253 aa  85.1  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000220763  hitchhiker  0.00713021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1771  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.91 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14870  pyrimidine reductase-like protein  36.76 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12686  hypothetical protein  34.18 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2219  hypothetical protein  34.83 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2208  hypothetical protein  34.83 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.579868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2265  hypothetical protein  34.83 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15570  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  35.93 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.154279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1345  hypothetical protein  34.07 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1375  deaminase-reductase domain-containing protein  60.32 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.653652  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2821  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.92 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1236  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.48 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.515775  normal  0.0776685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4689  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 		 250 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1898  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.24 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0996  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.18 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16600  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  31.47 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1580  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4013  deaminase-reductase domain-containing protein  31.38 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594838  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1964  hypothetical protein  32.68 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2490  hypothetical protein  33.79 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4752  hypothetical protein  32.26 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1555  hypothetical protein  31.11 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1500  hypothetical protein  29.07 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1951  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.61 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6709  Pyrimidine reductase riboflavin biosynthesis- like protein  34.1 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5167  hypothetical protein  32.85 
 
 		 270 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1733  bifunctional deaminase-reductase domain protein  57.41 
 
 		 262 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0581685  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7389  hypothetical protein  30.1 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1316  hypothetical protein  28.1 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3913  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028814  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.421498  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2257  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.92 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.196286 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1389  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.26 
 
 		 261 aa  48.5  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0920173  normal  0.1343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4154  hypothetical protein  30.85 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000358095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2926  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.29 
 
 		 392 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00060  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase /5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  33.94 
 
 		 355 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.168249  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2834  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.29 
 
 		 392 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0554952  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1274  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  34.81 
 
 		 366 aa  46.2  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.308593  normal  0.319876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3982  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.85 
 
 		 341 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2343  putative riboflavin-specific deaminase  28.74 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0945  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.03 
 
 		 371 aa  45.4  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0876  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  32.8 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.225628  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23990  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  27.42 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.649981  normal  0.0513609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.51 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00173437  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2397  deaminase-reductase domain-containing protein  29.57 
 
 		 412 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1858  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.91 
 
 		 386 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2342  bifunctional deaminase-reductase-like  27.96 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0699059  normal  0.0703576 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2141  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.98 
 
 		 351 aa  43.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293882 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1858  riboflavin biosynthesis protein RibD  25.13 
 
 		 347 aa  42.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4028  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.74 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1823  riboflavin biosynthesis protein RibD  25.13 
 
 		 347 aa  42.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.748712  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2447  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.93 
 
 		 345 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1749  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.9 
 
 		 367 aa  41.6  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294352  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0843  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.02 
 
 		 363 aa  41.6  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>