98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1733 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1733  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
262 aa  483  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0581685  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16600  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  49.81 
 
 
289 aa  158  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1236  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.44 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.515775  normal  0.0776685 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1316  hypothetical protein  42.06 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1389  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.75 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0920173  normal  0.1343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2821  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49 
 
 
269 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4154  hypothetical protein  45 
 
 
230 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000358095  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12686  hypothetical protein  41.2 
 
 
258 aa  115  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115861  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1884  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.19 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1580  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.33 
 
 
262 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1771  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.1 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1375  deaminase-reductase domain-containing protein  43.87 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.653652  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2265  hypothetical protein  42.27 
 
 
257 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425548  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2208  hypothetical protein  42.27 
 
 
257 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.579868  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2219  hypothetical protein  42.27 
 
 
257 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3543  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.44 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000220763  hitchhiker  0.00713021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23990  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  42.31 
 
 
258 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.649981  normal  0.0513609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7389  hypothetical protein  47.37 
 
 
258 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1345  hypothetical protein  41.47 
 
 
273 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.08 
 
 
263 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.421498  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4013  deaminase-reductase domain-containing protein  39.82 
 
 
251 aa  99  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594838  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2490  hypothetical protein  42.78 
 
 
264 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.380096 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14870  pyrimidine reductase-like protein  43.37 
 
 
263 aa  96.3  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15570  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  40.84 
 
 
229 aa  92  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.154279  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6709  Pyrimidine reductase riboflavin biosynthesis- like protein  44.91 
 
 
240 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1555  hypothetical protein  40.45 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3913  hypothetical protein  38.97 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028814  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1500  hypothetical protein  38.99 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5167  hypothetical protein  44.29 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197252  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4028  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.39 
 
 
242 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4752  hypothetical protein  40.37 
 
 
234 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2257  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  41.23 
 
 
240 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196286 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1898  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.25 
 
 
207 aa  85.1  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1964  hypothetical protein  37.79 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1951  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.1 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13790  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  43.01 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4689  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.12 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2279  deaminase-reductase domain-containing protein  36.7 
 
 
419 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296418  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2397  deaminase-reductase domain-containing protein  35.16 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0996  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.85 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.82 
 
 
221 aa  64.7  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1430  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.46 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0976803  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2343  putative riboflavin-specific deaminase  31.73 
 
 
230 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3461  riboflavin biosynthesis protein RibD  27.14 
 
 
401 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1770  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.86 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1313  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.6 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.82 
 
 
289 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0584067  normal  0.0428957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0690  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.17 
 
 
381 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1079  bifunctional deaminase-reductase-like  25.49 
 
 
364 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4462  riboflavin biosynthesis protein RibD:riboflavin-specific deaminase, C-terminal  33.01 
 
 
366 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0876  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.58 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.225628  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1576  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.57 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.210301 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0348  putative riboflavin-specific deaminase  33.16 
 
 
232 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5019  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  31.43 
 
 
376 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2135  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  33.67 
 
 
358 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.885222  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0944  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  30.24 
 
 
366 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01771  RibD/RibG domain-containing protein  25.37 
 
 
225 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.159904  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1474  pyrimidine reductase  25.37 
 
 
225 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0251  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.8 
 
 
255 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.04862  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0770  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.55 
 
 
234 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0680  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.17 
 
 
354 aa  48.9  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2570  deaminase-reductase domain-containing protein  31.39 
 
 
230 aa  48.9  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000741328 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02071  RibD/RibG domain-containing protein  32.63 
 
 
238 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2026  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.56 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0937  2, 5-diamino-6-(5-phosphoribosylamino)pyrimidin-4(3H)-one reductase  25.23 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0807982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1045  riboflavin-specific deaminase/reductase  31.22 
 
 
373 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00060  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase /5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  34.04 
 
 
355 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.168249  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1623  riboflavin biosynthesis protein RibD  24.14 
 
 
371 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217195  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1559  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.53 
 
 
369 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.855984  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0489  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.13 
 
 
232 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3492  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.01 
 
 
376 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160783  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2359  deaminase-reductase domain-containing protein  29.82 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2558  deaminase-reductase domain-containing protein  31.05 
 
 
229 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.4121  normal  0.303057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11400  riboflavin-specific deaminase/reductase  30.45 
 
 
373 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1870  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  28.24 
 
 
281 aa  45.8  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0226  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  24.44 
 
 
221 aa  45.8  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000414817  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1890  riboflavin biosynthesis protein RibD  27.18 
 
 
366 aa  45.4  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.22105  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2434  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  28.69 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.014094  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10850  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.67 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.103843  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0803  bifunctional deaminase-reductase-like  28.22 
 
 
227 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2639  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.63 
 
 
409 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.143151  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0960  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.51 
 
 
373 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0843  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.33 
 
 
363 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0481  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.51 
 
 
373 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0922  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.51 
 
 
373 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4064  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  32.51 
 
 
373 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2131  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis, RibD  24.62 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1561  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.72 
 
 
325 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00259219  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0416  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  24.35 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1683  deaminase-reductase domain-containing protein  30.21 
 
 
231 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.137585  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1658  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.46 
 
 
378 aa  42.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1181  bifunctional deaminase-reductase-like  30.37 
 
 
283 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0830  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.02 
 
 
373 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0804  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  26.88 
 
 
226 aa  42.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.301306  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0821  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.02 
 
 
373 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3099  riboflavin biosynthesis protein RibD  29.19 
 
 
383 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.791312  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0062  riboflavin biosynthesis protein RibD  27.91 
 
 
374 aa  42.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0451  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.01 
 
 
236 aa  42  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00233078  normal  0.376483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>