69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13790 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13790  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  100 
 
 		 248 aa  486  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16600  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  47.93 
 
 		 289 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12686  hypothetical protein  38.39 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4154  hypothetical protein  38.5 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000358095  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1771  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.13 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7389  hypothetical protein  40.69 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.65 
 
 		 263 aa  93.2  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.421498  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1316  hypothetical protein  38.36 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3543  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.6 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000220763  hitchhiker  0.00713021 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15570  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  35.62 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.154279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1389  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.22 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0920173  normal  0.1343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3913  hypothetical protein  37.45 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028814  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2490  hypothetical protein  38.25 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4028  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.97 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1236  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.17 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.515775  normal  0.0776685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2821  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.83 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2265  hypothetical protein  34.74 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2208  hypothetical protein  34.74 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.579868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2219  hypothetical protein  34.74 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5167  hypothetical protein  38.62 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6709  Pyrimidine reductase riboflavin biosynthesis- like protein  37.04 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4752  hypothetical protein  39.1 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1345  hypothetical protein  34.6 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1733  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.08 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0581685  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1898  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23990  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  31.71 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.649981  normal  0.0513609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1964  hypothetical protein  38.71 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2257  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.22 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.196286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1884  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.59 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2279  deaminase-reductase domain-containing protein  30.04 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296418  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14870  pyrimidine reductase-like protein  35.6 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1500  hypothetical protein  34.12 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1580  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2397  deaminase-reductase domain-containing protein  28.4 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4689  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.72 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4013  deaminase-reductase domain-containing protein  29.72 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594838  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1375  deaminase-reductase domain-containing protein  35.23 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.653652  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1555  hypothetical protein  30.67 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1951  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.25 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00060  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase /5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.88 
 
 		 355 aa  48.9  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.168249  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1474  pyrimidine reductase  23.96 
 
 		 225 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1173  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.31 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1874  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.86 
 
 		 353 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18140  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase /5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.57 
 
 		 393 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1867  riboflavin biosynthesis protein RibD  32 
 
 		 353 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.19 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00173437  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01771  RibD/RibG domain-containing protein  23.5 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.159904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0753  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.36 
 
 		 366 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.986595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2131  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis, RibD  27.43 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0319  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.54 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0690  riboflavin biosynthesis protein RibD  27.4 
 
 		 381 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2135  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  28.14 
 
 		 358 aa  45.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.885222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15710  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase /5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  28.17 
 
 		 349 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1378  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.95 
 
 		 363 aa  45.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1674  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.7 
 
 		 386 aa  45.4  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164227  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0348  putative riboflavin-specific deaminase  26.24 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3078  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  30.22 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.62381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2937  riboflavin biosynthesis protein RibD  25.41 
 
 		 352 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4462  riboflavin biosynthesis protein RibD:riboflavin-specific deaminase, C-terminal  28.77 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1079  bifunctional deaminase-reductase-like  27.08 
 
 		 364 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2256  riboflavin biosynthesis protein  30.64 
 
 		 365 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0544  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.79 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1187  riboflavin biosynthesis protein RibD  26.03 
 
 		 386 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.379971  normal  0.943234 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0996  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.89 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3421  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  29.83 
 
 		 365 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.823746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0021  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.22 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00371896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4551  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.61 
 
 		 215 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.28 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0584067  normal  0.0428957 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1352  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.57 
 
 		 224 aa  42  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0644907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>