71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15570 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_15570  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  100 
 
 		 229 aa  443  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.154279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4028  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.53 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1500  hypothetical protein  39.44 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1316  hypothetical protein  36.18 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16600  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  35.78 
 
 		 289 aa  105  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2821  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.12 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1771  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.7 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1345  hypothetical protein  35.95 
 
 		 273 aa  98.6  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1555  hypothetical protein  37.44 
 
 		 248 aa  95.5  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23990  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  34 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.649981  normal  0.0513609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4154  hypothetical protein  34.82 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000358095  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3543  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.71 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000220763  hitchhiker  0.00713021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6709  Pyrimidine reductase riboflavin biosynthesis- like protein  34.96 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.265333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1964  hypothetical protein  38.02 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1580  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.47 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2271  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.48 
 
 		 263 aa  89.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.421498  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12686  hypothetical protein  31.52 
 
 		 258 aa  89  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1389  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.73 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0920173  normal  0.1343 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1375  deaminase-reductase domain-containing protein  36.59 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.653652  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4752  hypothetical protein  36.67 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1733  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.84 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0581685  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7389  hypothetical protein  33.05 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1236  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.78 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.515775  normal  0.0776685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4013  deaminase-reductase domain-containing protein  31.97 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594838  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1951  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.26 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13790  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  35.19 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2208  hypothetical protein  32.67 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.579868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2219  hypothetical protein  32.67 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2265  hypothetical protein  32.67 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5167  hypothetical protein  39.07 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2279  deaminase-reductase domain-containing protein  29.66 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296418  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3913  hypothetical protein  35.79 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028814  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2257  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.48 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.196286 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0749  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.93 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14870  pyrimidine reductase-like protein  33.05 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1898  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4689  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.57 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1884  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.86 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2490  hypothetical protein  32.81 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1770  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.96 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2397  deaminase-reductase domain-containing protein  31.46 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.706771  hitchhiker  0.0000560766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.17 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00173437  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2342  bifunctional deaminase-reductase-like  31.28 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0699059  normal  0.0703576 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00060  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase /5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  36.81 
 
 		 355 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.168249  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0813  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.99 
 
 		 356 aa  53.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.35335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3982  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.87 
 
 		 341 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0996  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.82 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4551  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.52 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2135  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  30.49 
 
 		 358 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.885222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0876  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.82 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.225628  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1181  bifunctional deaminase-reductase-like  36.45 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01771  RibD/RibG domain-containing protein  25.14 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.159904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1674  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  32.72 
 
 		 386 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164227  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1474  pyrimidine reductase  25.99 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2343  putative riboflavin-specific deaminase  28.77 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0753  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.05 
 
 		 366 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.986595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1669  riboflavin biosynthesis protein RibD  30.67 
 
 		 373 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.04431e-16 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0680  riboflavin biosynthesis protein RibD  32.61 
 
 		 354 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18140  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase /5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.35 
 
 		 393 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1430  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.89 
 
 		 251 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0976803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  22.78 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0498  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.33 
 
 		 362 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.67 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0584067  normal  0.0428957 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10850  riboflavin biosynthesis protein RibD  30 
 
 		 377 aa  43.5  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.103843  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1161  riboflavin biosynthesis protein RibD  25.9 
 
 		 357 aa  43.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  36.51 
 
 		 177 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2558  deaminase-reductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.4121  normal  0.303057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1683  deaminase-reductase domain-containing protein  26.74 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.137585  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1274  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.57 
 
 		 366 aa  42  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.308593  normal  0.319876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5288  deaminase-reductase domain-containing protein  34.94 
 
 		 252 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122038  normal  0.871149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0715  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.95 
 
 		 370 aa  41.6  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>