74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4398 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4398  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 225 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0716  putative pyrimidine reductase  93.78 
 
 		 225 aa  433  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3284  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.64 
 
 		 245 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3358  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.37 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2727  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  41.33 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  0.18578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2883  deaminase-reductase domain-containing protein  39.91 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154582  normal  0.528323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6142  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  40.85 
 
 		 239 aa  157  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8339  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  40.25 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.93 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.37 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.650924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.96 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4269  deaminase-reductase domain-containing protein  34.96 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.784673  normal  0.386339 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1915  deaminase-reductase domain-containing protein  38.05 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3920  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  36.29 
 
 		 240 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03960  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  29.83 
 
 		 246 aa  101  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.16 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1843  deaminase-reductase domain-containing protein  28.67 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.53223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1919  hypothetical protein  41.46 
 
 		 84 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1398  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  33.73 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1181  bifunctional deaminase-reductase-like  32.61 
 
 		 283 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0908  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  32.53 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000531034 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0643  hypothetical protein  28.89 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0226  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  33.71 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000414817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3857  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  34.52 
 
 		 371 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0446  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  24.47 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0604  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  26.15 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4050  riboflavin biosynthesis protein RibD  26.01 
 
 		 384 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5288  deaminase-reductase domain-containing protein  36.49 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122038  normal  0.871149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0996  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.79 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1908  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase, 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  34.41 
 
 		 364 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1555  hypothetical protein  31.91 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0876  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  28.35 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.225628  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1500  hypothetical protein  34.18 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2570  deaminase-reductase domain-containing protein  32.04 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000741328 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2945  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  38.89 
 
 		 377 aa  46.2  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.308667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2926  riboflavin biosynthesis protein RibD  46.3 
 
 		 392 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0804  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.78 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.301306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2834  riboflavin biosynthesis protein RibD  46.3 
 
 		 392 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0554952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0251  bifunctional deaminase-reductase domain protein  21.58 
 
 		 255 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.04862  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2385  riboflavin biosynthesis protein RibD  42.86 
 
 		 368 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.811979  hitchhiker  0.00228215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1345  hypothetical protein  32.67 
 
 		 273 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3555  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.07 
 
 		 377 aa  45.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.49964  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2742  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  46.3 
 
 		 392 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0543  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.75 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0940433  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0944  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  46.15 
 
 		 366 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1816  riboflavin biosynthesis protein RibD  50 
 
 		 383 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162198  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2279  deaminase-reductase domain-containing protein  28.71 
 
 		 419 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296418  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0659  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  22.05 
 
 		 357 aa  44.3  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0770  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.47 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1619  riboflavin biosynthesis protein RibD  26.09 
 
 		 385 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5167  hypothetical protein  32.91 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1010  riboflavin biosynthesis protein RibD  45.9 
 
 		 377 aa  43.5  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0727  riboflavin biosynthesis protein RibD  39.74 
 
 		 366 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0593  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  20.4 
 
 		 360 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.075481  normal  0.240855 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0937  2, 5-diamino-6-(5-phosphoribosylamino)pyrimidin-4(3H)-one reductase  36.92 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0807982 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04401  riboflavin biosynthesis protein RibD  35.44 
 
 		 369 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.607399  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2094  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1122  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  26.91 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.858422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1829  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.68 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0951762  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1848  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.33 
 
 		 364 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1742  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  26.46 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0665302 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2416  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.73 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.189803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2459  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.36 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.033836  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0319  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.26 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0753  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.67 
 
 		 366 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.986595 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0385  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.1 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.216591 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0807  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.51 
 
 		 226 aa  42  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185302  normal  0.290078 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1869  riboflavin biosynthesis protein RibD  35.62 
 
 		 386 aa  42  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0680786  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1352  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.78 
 
 		 224 aa  42  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0644907 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 177 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1236  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25 
 
 		 251 aa  41.6  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.515775  normal  0.0776685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4028  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.87 
 
 		 242 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0835  ribD C-terminal domain protein  29.49 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4278  riboflavin biosynthesis protein RibD  37.14 
 
 		 383 aa  41.6  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23466  normal  0.0329516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>