29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1919 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1919  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  167  6e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1915  deaminase-reductase domain-containing protein  96.43 
 
 		 225 aa  164  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.78 
 
 		 238 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.650924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3920  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  41.18 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.15 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6142  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  43.33 
 
 		 239 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4398  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.46 
 
 		 225 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0716  putative pyrimidine reductase  41.46 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4269  deaminase-reductase domain-containing protein  46.34 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.784673  normal  0.386339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2727  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  40.91 
 
 		 239 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  0.18578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.96 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2883  deaminase-reductase domain-containing protein  42.5 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154582  normal  0.528323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3358  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.75 
 
 		 246 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3284  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.74 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8339  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  38.89 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03960  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  38.46 
 
 		 246 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.08 
 
 		 234 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1843  deaminase-reductase domain-containing protein  35.29 
 
 		 329 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.53223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0604  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  39.71 
 
 		 222 aa  47  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0996  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.49 
 
 		 241 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5200  2,5-diamino-6-hydroxy-4-(5- phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  35.44 
 
 		 220 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.63994  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0660  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  36.05 
 
 		 247 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00276533  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0804  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  40 
 
 		 226 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.301306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.06 
 
 		 193 aa  41.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0937  2, 5-diamino-6-(5-phosphoribosylamino)pyrimidin-4(3H)-one reductase  33.33 
 
 		 225 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0807982 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0230  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.58 
 
 		 360 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0451  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  36.11 
 
 		 236 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00233078  normal  0.376483 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2416  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  37.33 
 
 		 223 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.189803 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0643  hypothetical protein  38.98 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>