52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3920 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3920  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  100 
 
 
240 aa  495  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03960  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  42.5 
 
 
246 aa  202  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3358  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.71 
 
 
246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3284  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.74 
 
 
245 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.24 
 
 
238 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2883  deaminase-reductase domain-containing protein  37.04 
 
 
244 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154582  normal  0.528323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4269  deaminase-reductase domain-containing protein  37.34 
 
 
238 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.784673  normal  0.386339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.93 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.650924  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4398  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.29 
 
 
225 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0716  putative pyrimidine reductase  33.9 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6142  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  35.39 
 
 
239 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8339  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.98 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1915  deaminase-reductase domain-containing protein  32.92 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.56 
 
 
234 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2727  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.58 
 
 
239 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  0.18578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1843  deaminase-reductase domain-containing protein  28.92 
 
 
329 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.53223  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.05 
 
 
297 aa  85.5  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1919  hypothetical protein  41.18 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2416  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  37.5 
 
 
223 aa  58.5  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.189803 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0937  2, 5-diamino-6-(5-phosphoribosylamino)pyrimidin-4(3H)-one reductase  27.52 
 
 
225 aa  56.6  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0807982 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1048  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  25.51 
 
 
223 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0226  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  32.69 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000414817  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1313  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25.56 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0643  hypothetical protein  28.57 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0804  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  26.17 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.301306  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0543  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  33.86 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0940433  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0908  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.68 
 
 
226 aa  52.8  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000531034 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0604  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  37.31 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2352  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  35 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000292677  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0660  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  24.7 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00276533  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1398  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.47 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5200  2,5-diamino-6-hydroxy-4-(5- phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  29.87 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.63994  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1829  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0951762  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2026  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  20.1 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0593  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  23.77 
 
 
360 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.075481  normal  0.240855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4689  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.31 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0446  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  29.13 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0067  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.47 
 
 
222 aa  46.6  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.679825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0104  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase / diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  25.33 
 
 
365 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2575  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  33.03 
 
 
225 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0416  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  34.86 
 
 
217 aa  46.2  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3599  5-amino-6-(5- phosphoribosylamino)uracilreductase  25.13 
 
 
319 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922872 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3078  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  37.88 
 
 
220 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.62381  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0230  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  28.57 
 
 
360 aa  45.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0020  riboflavin biosynthesis protein RibD  26.92 
 
 
360 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1325  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.67 
 
 
360 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.264081  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0021  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  41.3 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00371896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0489  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  23.56 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0710  riboflavin biosynthesis protein RibD  25.12 
 
 
360 aa  42.7  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2094  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.43 
 
 
234 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0807  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  35.82 
 
 
226 aa  42.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185302  normal  0.290078 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2006  riboflavin biosynthesis protein RibD  25.37 
 
 
367 aa  42  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0408562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>