89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7675 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 157 aa  302  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  67.57 
 
 		 157 aa  191  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  61.97 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  46.55 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 152 aa  51.2  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  33.93 
 
 		 143 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  30.68 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  37.18 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  45.1 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  28.99 
 
 		 283 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  44.23 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  46 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  44.23 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 303 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  46 
 
 		 172 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  53.06 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4541  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.786222  normal  0.801932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4454  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4836  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 157 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 143 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  21.17 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0374  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 250 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 158 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  21.17 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 142 aa  41.2  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  21.17 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 175 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 192 aa  41.2  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 186 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 186 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  21.17 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  21.17 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 158 aa  40.8  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  21.17 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  21.17 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  21.17 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  21.17 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 161 aa  40.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  21.17 
 
 		 148 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  44.68 
 
 		 186 aa  40.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>