More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6822 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  100 
 
 		 741 aa  1451    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  50.13 
 
 		 796 aa  622  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  48.13 
 
 		 783 aa  580  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  43.71 
 
 		 724 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  42.66 
 
 		 770 aa  491  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  42.28 
 
 		 751 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  41.42 
 
 		 769 aa  479  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  41.42 
 
 		 769 aa  479  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  41.51 
 
 		 773 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  43.09 
 
 		 738 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  40.38 
 
 		 1155 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  40.48 
 
 		 736 aa  453  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  41.85 
 
 		 727 aa  449  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.94 
 
 		 740 aa  443  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  41.22 
 
 		 748 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  41.22 
 
 		 754 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  40 
 
 		 767 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  39.87 
 
 		 767 aa  439  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  39.87 
 
 		 767 aa  439  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  39.19 
 
 		 839 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  41.69 
 
 		 743 aa  432  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  41.37 
 
 		 778 aa  432  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  38.44 
 
 		 953 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  37.25 
 
 		 766 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  38.81 
 
 		 733 aa  422  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  38.55 
 
 		 738 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  36.79 
 
 		 710 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  36.09 
 
 		 740 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  38.53 
 
 		 717 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  40.16 
 
 		 731 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  37.48 
 
 		 738 aa  392  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  37.5 
 
 		 731 aa  389  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  36.09 
 
 		 758 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.76 
 
 		 1308 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  37.08 
 
 		 762 aa  345  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  32.75 
 
 		 805 aa  342  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.51 
 
 		 1095 aa  317  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  33.94 
 
 		 761 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  31.94 
 
 		 741 aa  313  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.6 
 
 		 738 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  33.39 
 
 		 997 aa  300  9e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  42.46 
 
 		 500 aa  299  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  33.98 
 
 		 743 aa  298  3e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  29.37 
 
 		 1013 aa  298  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  30.17 
 
 		 944 aa  290  7e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.29 
 
 		 740 aa  280  6e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  28.69 
 
 		 730 aa  278  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  28.09 
 
 		 730 aa  278  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.96 
 
 		 730 aa  277  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.96 
 
 		 730 aa  277  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.96 
 
 		 730 aa  277  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.82 
 
 		 730 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  37.16 
 
 		 709 aa  274  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.8 
 
 		 730 aa  271  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  28.51 
 
 		 730 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  28.09 
 
 		 730 aa  266  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  27.03 
 
 		 730 aa  266  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  28.73 
 
 		 729 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  31.23 
 
 		 743 aa  260  6e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  34.34 
 
 		 757 aa  256  8e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  34.88 
 
 		 737 aa  246  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  34.75 
 
 		 745 aa  240  5.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  30.97 
 
 		 717 aa  238  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  34.02 
 
 		 758 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  32.63 
 
 		 729 aa  234  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  30.74 
 
 		 735 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  31.85 
 
 		 752 aa  232  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  29.95 
 
 		 842 aa  231  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  32.05 
 
 		 750 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  32.31 
 
 		 723 aa  231  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  33.16 
 
 		 740 aa  228  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  31.79 
 
 		 846 aa  228  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  30.28 
 
 		 735 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  32.06 
 
 		 781 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  33.38 
 
 		 751 aa  217  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  29.19 
 
 		 737 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 		 761 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  29.68 
 
 		 736 aa  213  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0724  MMPL domain protein  31.19 
 
 		 718 aa  213  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  35.26 
 
 		 724 aa  208  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  30.45 
 
 		 758 aa  207  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  31.8 
 
 		 743 aa  207  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  28.8 
 
 		 983 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  28.8 
 
 		 983 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  31.2 
 
 		 745 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  28.8 
 
 		 979 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  27.08 
 
 		 743 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  28.91 
 
 		 718 aa  204  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  27.41 
 
 		 704 aa  202  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  32.71 
 
 		 732 aa  203  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.62 
 
 		 723 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0208  MMPL domain-containing protein  32.23 
 
 		 734 aa  201  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  27.71 
 
 		 978 aa  202  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.42 
 
 		 726 aa  201  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  34.85 
 
 		 715 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  30.49 
 
 		 728 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  32.04 
 
 		 741 aa  198  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  31.19 
 
 		 734 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  31.19 
 
 		 793 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1227  MMPL  33.49 
 
 		 814 aa  194  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>