More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5539 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5539  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 390 aa  773    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.904525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2849  cystathionine gamma-synthase  63.61 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3943  cystathionine gamma-synthase  65.79 
 
 		 382 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142296  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24950  cystathionine gamma-synthase  62.99 
 
 		 393 aa  461  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8098  Cystathionine gamma-synthase  63.33 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  42.09 
 
 		 396 aa  266  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  39.14 
 
 		 401 aa  265  8e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  40.86 
 
 		 398 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  40.61 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  40 
 
 		 391 aa  258  9e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  40.1 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  40.11 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  39.04 
 
 		 392 aa  256  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  40.05 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  39.04 
 
 		 392 aa  255  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  38.58 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  39.65 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  39.29 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  40.5 
 
 		 391 aa  253  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  39.04 
 
 		 392 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  38.64 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  38.79 
 
 		 392 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  39.04 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  39.04 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  41.22 
 
 		 392 aa  249  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  39.8 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  42.6 
 
 		 394 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  37.63 
 
 		 392 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  38.87 
 
 		 397 aa  246  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  38.78 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  39.35 
 
 		 413 aa  245  8e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  37.97 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  40.29 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  40.36 
 
 		 399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  39.13 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  39.9 
 
 		 391 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  38.62 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  39.9 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  38.62 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  39.59 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  38.11 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  39.09 
 
 		 397 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  39.64 
 
 		 397 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  38.36 
 
 		 397 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1897  cystathionine gamma-synthase  38.85 
 
 		 393 aa  238  9e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.769233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  40.25 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  36.73 
 
 		 399 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.95 
 
 		 393 aa  238  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  37.88 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  39.64 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  38.07 
 
 		 380 aa  236  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  38.17 
 
 		 378 aa  236  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  40.65 
 
 		 399 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  41.03 
 
 		 383 aa  235  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  44.61 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  39.09 
 
 		 418 aa  234  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  43.11 
 
 		 401 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  38.52 
 
 		 400 aa  232  9e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  40.2 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.53 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.53 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  38.64 
 
 		 392 aa  229  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  36.96 
 
 		 383 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  40.66 
 
 		 372 aa  229  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  37.91 
 
 		 386 aa  229  7e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  36.39 
 
 		 427 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  39.61 
 
 		 394 aa  229  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  35.44 
 
 		 427 aa  229  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  39.23 
 
 		 373 aa  229  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.94 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  38.35 
 
 		 374 aa  228  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  38.4 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  41.37 
 
 		 377 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  45.13 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  40.55 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  38.28 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  36.17 
 
 		 427 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  41.11 
 
 		 377 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.12 
 
 		 394 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.11 
 
 		 396 aa  226  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1981  cystathionine gamma-synthase  38.55 
 
 		 400 aa  225  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  40.65 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  39.05 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6803  cystathionine gamma-synthase  42.01 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  39.39 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.42 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  38.73 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  38.99 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4838  cystathionine gamma-synthase  42.01 
 
 		 389 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.370286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4283  cystathionine gamma-synthase  41.72 
 
 		 389 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940043  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.61 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  38.99 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  39.9 
 
 		 398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  39.59 
 
 		 388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  37.79 
 
 		 377 aa  222  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.13 
 
 		 404 aa  222  9e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.13 
 
 		 404 aa  222  9e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  37.65 
 
 		 392 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  39.74 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.64 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>