More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0975 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0975  ABC transporter related  100 
 
 		 391 aa  763    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  64.38 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  66.23 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  65.25 
 
 		 304 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4278  ABC transporter related protein  63.7 
 
 		 356 aa  355  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.786562  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1852  ABC transporter related protein  62.71 
 
 		 304 aa  342  5e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0481458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  59.67 
 
 		 301 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0454  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 316 aa  333  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.815425  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4445  ABC transporter related  56.96 
 
 		 313 aa  323  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06860  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.77 
 
 		 323 aa  282  6.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3977  ABC transporter related  42.26 
 
 		 315 aa  219  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2233  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0193643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  41.8 
 
 		 331 aa  176  9e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  40.58 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  33.44 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  39.01 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  42.4 
 
 		 309 aa  169  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  32.48 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  41.2 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  31.95 
 
 		 325 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  31.82 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  38.72 
 
 		 313 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  38.56 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 317 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  37.59 
 
 		 310 aa  163  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.69 
 
 		 316 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.4 
 
 		 317 aa  162  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 		 313 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.93 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  41.2 
 
 		 317 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  42.79 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  41.1 
 
 		 288 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  36.36 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  36.12 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  36.36 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  41.01 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  36.93 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.45 
 
 		 338 aa  160  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  42.04 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.7 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.7 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  40 
 
 		 350 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  43.24 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.89 
 
 		 317 aa  159  8e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  33.23 
 
 		 360 aa  159  9e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 334 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.04 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  37.66 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  38.12 
 
 		 236 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.43 
 
 		 333 aa  158  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 356 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  40.64 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 		 334 aa  157  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 288 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  44.3 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.26 
 
 		 309 aa  156  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  38.7 
 
 		 309 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  36.96 
 
 		 314 aa  156  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  41.21 
 
 		 290 aa  156  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  39.17 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.22 
 
 		 339 aa  155  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  36.33 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  39.71 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  34.75 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  40.45 
 
 		 287 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  40.53 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  34.67 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  37 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1124  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.98 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  39.69 
 
 		 747 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 312 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  37.04 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  34.1 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.54 
 
 		 351 aa  153  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  38.29 
 
 		 337 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  40.91 
 
 		 304 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  37.1 
 
 		 235 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  33.66 
 
 		 310 aa  152  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1235  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.83 
 
 		 368 aa  152  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  37.05 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  40.99 
 
 		 314 aa  152  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4550  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 		 314 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  41.56 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  37.05 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  37.79 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  38.63 
 
 		 247 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  36.24 
 
 		 305 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  35.29 
 
 		 331 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  34.56 
 
 		 305 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.69 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 		 320 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 300 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.79 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  37.05 
 
 		 300 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>