More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5042 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 415 aa  842    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0435  hypothetical protein  30.57 
 
 		 431 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  31.21 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  28.03 
 
 		 425 aa  169  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  27.45 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  29.19 
 
 		 441 aa  160  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  26.97 
 
 		 411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  28.26 
 
 		 406 aa  147  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  26.46 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3197  hypothetical protein  28.64 
 
 		 427 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2660  hypothetical protein  30.21 
 
 		 410 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2497  hypothetical protein  29.23 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05401  hypothetical protein  28.49 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  27.84 
 
 		 411 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  24.21 
 
 		 830 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1429  hypothetical protein  28.81 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001464  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  28.45 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  26.4 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  29.41 
 
 		 422 aa  126  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  29.41 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  27.6 
 
 		 404 aa  123  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  26.81 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  27.22 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  25.16 
 
 		 295 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  25.87 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  27.39 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1663  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 		 535 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  25.46 
 
 		 412 aa  107  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.2 
 
 		 415 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  26.1 
 
 		 403 aa  99.8  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1310  hypothetical protein  24.78 
 
 		 409 aa  99.4  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  26.13 
 
 		 406 aa  96.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  26.47 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.17 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  22.6 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  25.7 
 
 		 404 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  26.85 
 
 		 414 aa  94  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  26.83 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  24.17 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  26.05 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  25.94 
 
 		 413 aa  87.8  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0857  protein of unknown function DUF214  28.22 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  22.01 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  28.11 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.86 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23270  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.54 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.56 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1920  protein of unknown function DUF214  24.41 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.911684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2903  hypothetical protein  25.81 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  22.77 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  21.25 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  24.89 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.42 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.55 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2285  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.03 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0114014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1814  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.4 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.109352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.86 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1734  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.71 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00172788  normal  0.754695 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  25.68 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3974  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 		 952 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2259  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC, putative  23.96 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2154  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.12 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  22.89 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  24.47 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.46 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.24 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1671  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.38 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.966628  normal  0.962664 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  22.95 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  23.48 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.43 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.64 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1118  hypothetical protein  24.4 
 
 		 661 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.04 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  21.85 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  23.34 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  24.56 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.56 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.97 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  20.14 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2826  protein of unknown function DUF214  22.56 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.663211  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  23.34 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2257  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  21.1 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0081  hypothetical protein  22.2 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.466459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.75 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.61 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  23.08 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  28.42 
 
 		 821 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4462  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.94 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1850  ABC transporter, permease protein, putative  22.51 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.79 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.16 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.32 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0832  protein of unknown function DUF214  23.55 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1541  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.82 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.470748  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.54 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  23.66 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2154  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.29 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0219351 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.71 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1695  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.29 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>