More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3860 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3860  BCCT family transporter  100 
 
 		 519 aa  1029    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3674  BCCT transporter  61.71 
 
 		 549 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1813  BCCT transporter  58.49 
 
 		 561 aa  639    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1238  BCCT transporter  58.49 
 
 		 554 aa  650    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332872 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0815  BCCT transporter  63.78 
 
 		 530 aa  679    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.820785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000659  putative glycine betaine transporter  63.35 
 
 		 528 aa  649    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0875  glycine betaine transporter OpuD  62.55 
 
 		 524 aa  648    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2126  BCCT transporter  63.2 
 
 		 533 aa  692    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00109884  hitchhiker  0.00218719 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06536  choline/carnitine/betaine transporter  62.77 
 
 		 539 aa  646    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0335  BCCT transporter  58.16 
 
 		 534 aa  611  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.568613  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5125  BCCT family osmoprotectant transporter  59.48 
 
 		 522 aa  608  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5298  BCCT family osmoprotectant transporter  59.48 
 
 		 522 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5694  BCCT family osmoprotectant transporter  59.48 
 
 		 522 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5539  osmoprotectant transporter, BCCT family  59.48 
 
 		 522 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5577  BCCT family osmoprotectant transporter  58.87 
 
 		 522 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5140  BCCT family osmoprotectant transporter  59.27 
 
 		 522 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5237  BCCT transporter  59.07 
 
 		 522 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5625  osmoprotectant transporter, BCCT family  58.47 
 
 		 522 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5380  osmoprotectant transporter, BCCT family  58.67 
 
 		 522 aa  586  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.274616  normal  0.0982886 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3383  BCCT transporter  59.53 
 
 		 514 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5569  osmoprotectant transporter, BCCT family  58.27 
 
 		 522 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0579  choline-glycine betaine transporter  58.23 
 
 		 519 aa  570  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3060  BCCT transporter  53.65 
 
 		 516 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2692  BCCT family transporter  53.46 
 
 		 516 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2888  BCCT transporter  50.86 
 
 		 555 aa  520  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696836  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2887  BCCT transporter  52.01 
 
 		 529 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2920  BCCT transporter  50.78 
 
 		 518 aa  478  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00190717  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2467  BCCT transporter  47.46 
 
 		 537 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16031  hypothetical protein  37.38 
 
 		 519 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.034717  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0251  BCCT family glycine betaine transporter  39.52 
 
 		 516 aa  350  4e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05503  choline/carnitine/betaine transporter  54.52 
 
 		 341 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0223  BCCT family glycine betaine transporter  40.87 
 
 		 518 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  34.32 
 
 		 551 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  34.58 
 
 		 659 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  34.89 
 
 		 550 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  34.16 
 
 		 659 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  35.51 
 
 		 503 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  32.72 
 
 		 494 aa  256  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  34.46 
 
 		 506 aa  256  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  33.64 
 
 		 538 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  34.58 
 
 		 531 aa  250  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  34.01 
 
 		 661 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  33.13 
 
 		 606 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  35.48 
 
 		 545 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  33.26 
 
 		 542 aa  246  9e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  32.75 
 
 		 657 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  33.99 
 
 		 667 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  33.61 
 
 		 661 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  33.7 
 
 		 523 aa  240  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  31.42 
 
 		 553 aa  239  6.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  29.47 
 
 		 526 aa  239  8e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  30.45 
 
 		 558 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  32.28 
 
 		 520 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  34.57 
 
 		 530 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  30.64 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  32.28 
 
 		 520 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  33.27 
 
 		 644 aa  236  6e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  31.95 
 
 		 637 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  32.71 
 
 		 637 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  33.76 
 
 		 498 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  31.54 
 
 		 656 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  33.13 
 
 		 646 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0237  choline/carnitine/betaine transporter  31.57 
 
 		 550 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000527978  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  32.72 
 
 		 573 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  34.69 
 
 		 546 aa  234  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2645  choline transport protein BetT  33.74 
 
 		 684 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00290709  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  35.73 
 
 		 529 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  31.65 
 
 		 556 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  32.44 
 
 		 606 aa  233  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  31.37 
 
 		 530 aa  233  8.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0309  choline/carnitine/betaine transporter  34.57 
 
 		 552 aa  233  8.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.670789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  31.9 
 
 		 516 aa  233  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  31.68 
 
 		 516 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  31.68 
 
 		 516 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  31.68 
 
 		 516 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  31.68 
 
 		 516 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0223  choline transport protein BetT  31.8 
 
 		 686 aa  231  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  32.34 
 
 		 548 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1121  choline/carnitine/betaine transporter  33.62 
 
 		 611 aa  230  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  32.34 
 
 		 548 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  31.47 
 
 		 516 aa  230  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  31.47 
 
 		 516 aa  230  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  31.24 
 
 		 603 aa  230  6e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  31.73 
 
 		 497 aa  229  6e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  31.68 
 
 		 516 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  32.36 
 
 		 538 aa  229  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  31.47 
 
 		 516 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1512  choline transport protein BetT  32 
 
 		 679 aa  229  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0971262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  30.77 
 
 		 584 aa  229  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  31.25 
 
 		 505 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0190  BCCT transporter  31.15 
 
 		 525 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  31.25 
 
 		 505 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  31.28 
 
 		 534 aa  229  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  32.1 
 
 		 660 aa  228  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  32.48 
 
 		 685 aa  228  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  33.57 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  32.1 
 
 		 698 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0023  choline/carnitine/betaine transporter  31.77 
 
 		 539 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.16107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  31.25 
 
 		 505 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  34.84 
 
 		 544 aa  227  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>