242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2740 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2740  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  919    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0954  peptidase S41  63.37 
 
 		 451 aa  591  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432114  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2226  peptidase S41  40.13 
 
 		 455 aa  319  7.999999999999999e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2272  peptidase S41  23.61 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2604  hypothetical protein  29.02 
 
 		 516 aa  77.4  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  27.93 
 
 		 341 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  29.44 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  27.14 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1620  carboxyl-terminal protease-related protein  28.17 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  27.33 
 
 		 710 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  24.1 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1277  peptidase S41  22.78 
 
 		 547 aa  67  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  21.56 
 
 		 465 aa  66.6  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3801  peptidase S41  22.95 
 
 		 747 aa  66.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0586877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1724  peptidase S41  29.06 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  25.51 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  23.04 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  26.64 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  26.85 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  23.95 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  26.81 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  23.27 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  24.03 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  25.09 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  25.27 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  23.7 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  20.33 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  20.84 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  23.81 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  23.27 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  27.39 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  26.05 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  26.14 
 
 		 441 aa  57  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  20.84 
 
 		 482 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3517  peptidase S41  20.56 
 
 		 432 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0636352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2615  peptidase S41  20.15 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  23.53 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  25.43 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  23.28 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  25.27 
 
 		 443 aa  56.6  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  25.76 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  28.14 
 
 		 449 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  23.58 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  24.82 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  25.87 
 
 		 480 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  28.18 
 
 		 569 aa  55.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  23.62 
 
 		 442 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  23.44 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  24.02 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3207  peptidase S41  21.77 
 
 		 692 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000881492  normal  0.0220331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 461 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  25.18 
 
 		 547 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  24.3 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  25.47 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  27.1 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  25.49 
 
 		 550 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  25.26 
 
 		 434 aa  55.1  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  25.25 
 
 		 410 aa  55.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  22.22 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1216  peptidase S41  29.47 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.683381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  23.66 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  22.22 
 
 		 478 aa  54.7  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  26.21 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  25.25 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  22.63 
 
 		 476 aa  54.3  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  22.85 
 
 		 479 aa  54.3  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  22.35 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  23.74 
 
 		 456 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  24.1 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0686  peptidase S41  27.57 
 
 		 539 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 439 aa  53.9  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  23.05 
 
 		 479 aa  53.9  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2935  peptidase S41  21.26 
 
 		 691 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000791887  normal  0.0220512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  24.68 
 
 		 445 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  24.18 
 
 		 402 aa  53.5  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  23.35 
 
 		 477 aa  53.5  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  24.9 
 
 		 445 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  24.18 
 
 		 402 aa  53.1  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  26.51 
 
 		 439 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  23.69 
 
 		 472 aa  53.5  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  25.38 
 
 		 441 aa  53.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 481 aa  53.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0038  C-terminal processing peptidase  25.51 
 
 		 534 aa  53.1  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  22.85 
 
 		 478 aa  53.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  23.88 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  25.82 
 
 		 582 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 538 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  23.53 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  23.23 
 
 		 458 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2516  carboxyl-terminal protease  23.78 
 
 		 1024 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  25.41 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4589  peptidase S41  28.39 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  23.22 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  26.63 
 
 		 377 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  24.39 
 
 		 457 aa  51.6  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  23.05 
 
 		 479 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  27.73 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3345  S41 family protease  27.13 
 
 		 337 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  26.5 
 
 		 490 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>