144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2664 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  922    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  70.48 
 
 
392 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  52.86 
 
 
432 aa  486  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  44.34 
 
 
435 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  43.95 
 
 
433 aa  378  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  42.59 
 
 
435 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  41.22 
 
 
433 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  42.66 
 
 
434 aa  372  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  43.06 
 
 
430 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  40.77 
 
 
430 aa  336  5.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  39.16 
 
 
433 aa  329  5.0000000000000004e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  38.15 
 
 
429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  36.45 
 
 
426 aa  286  7e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  32.9 
 
 
380 aa  187  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  28.28 
 
 
418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  30.87 
 
 
391 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  27.05 
 
 
444 aa  155  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  29.95 
 
 
431 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  27.99 
 
 
419 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  29.15 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  29.8 
 
 
419 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  29.8 
 
 
419 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  28.78 
 
 
418 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  27.86 
 
 
419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  25.69 
 
 
449 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  24.47 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  29.25 
 
 
429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  26.81 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  24.76 
 
 
412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  28.33 
 
 
407 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  27.73 
 
 
295 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  27.27 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  25.98 
 
 
441 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  25.52 
 
 
414 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  25.58 
 
 
430 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  24.58 
 
 
412 aa  90.9  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  27.65 
 
 
420 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  26.14 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  25.13 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  26.44 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  25.12 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  25.95 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  25.83 
 
 
423 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  24.26 
 
 
415 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  23.62 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  27.71 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  24.43 
 
 
405 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  24.92 
 
 
390 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  23.84 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  25.62 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  24.5 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  26.16 
 
 
430 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  24.85 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  26.49 
 
 
430 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  25.45 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  22.67 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  26.04 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  26.82 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  24.04 
 
 
431 aa  70.1  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  26.39 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  23.96 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  22.67 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  32.14 
 
 
120 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  25.74 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  36.44 
 
 
415 aa  67  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  25.85 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  26.39 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  24.18 
 
 
434 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  24.18 
 
 
434 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  24.27 
 
 
431 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  30.32 
 
 
312 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  23.59 
 
 
440 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  29.84 
 
 
410 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  24.33 
 
 
418 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  27.23 
 
 
415 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  28.79 
 
 
415 aa  63.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  27.55 
 
 
382 aa  63.2  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  30.77 
 
 
410 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  22.61 
 
 
460 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  24.64 
 
 
434 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  24.64 
 
 
434 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  26.03 
 
 
404 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  24.25 
 
 
440 aa  60.1  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  25.77 
 
 
435 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  24.41 
 
 
422 aa  59.7  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  24.29 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  24.28 
 
 
435 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  25.89 
 
 
400 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  25.73 
 
 
318 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  26.35 
 
 
447 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  24.8 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  25.73 
 
 
318 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  27.56 
 
 
362 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  23.01 
 
 
425 aa  54.3  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  23.06 
 
 
430 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  27.01 
 
 
152 aa  54.3  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  27.34 
 
 
430 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  28.38 
 
 
435 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  22.32 
 
 
433 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  24.53 
 
 
430 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>