More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1826 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  100 
 
 		 1000 aa  2019    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  32.38 
 
 		 987 aa  451  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  32.42 
 
 		 984 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  31.96 
 
 		 985 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2131  response regulator, histidine kinase  31.24 
 
 		 958 aa  431  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.739788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1992  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 999 aa  343  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.721903  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3365  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 		 1009 aa  337  7e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3532  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.42 
 
 		 996 aa  335  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.403445 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2801  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1041 aa  326  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2131  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.76 
 
 		 900 aa  326  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1230  sensor histidine kinase/response regulator TorS  30.15 
 
 		 1025 aa  325  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1114  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 1017 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2321  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.21 
 
 		 914 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00396933  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1104  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.21 
 
 		 914 aa  320  7e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2602  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.24 
 
 		 904 aa  320  7e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1110  hybrid sensory histidine kinase TorS  30.7 
 
 		 914 aa  320  7.999999999999999e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00372691  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1152  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 		 1025 aa  320  9e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00996  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with TorR  29.21 
 
 		 914 aa  320  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.458275  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01003  hypothetical protein  29.21 
 
 		 914 aa  320  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.624093  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1049  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 		 1017 aa  319  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3242  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 		 980 aa  318  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 		 1020 aa  318  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3345  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 1038 aa  318  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1229  hybrid sensory histidine kinase TorS  29 
 
 		 904 aa  318  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3215  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.08 
 
 		 1020 aa  317  6e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3215  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 		 1030 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2649  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 		 899 aa  313  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0141024  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4109  hybrid sensory histidine kinase TorS  32.21 
 
 		 895 aa  313  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4054  hybrid sensory histidine kinase TorS  32.06 
 
 		 923 aa  312  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4158  hybrid sensory histidine kinase TorS  32.06 
 
 		 895 aa  312  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.315093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4216  hybrid sensory histidine kinase TorS  31.73 
 
 		 895 aa  311  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4037  hybrid sensory histidine kinase TorS  31.87 
 
 		 895 aa  310  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  29 
 
 		 1017 aa  308  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.94198 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0985  sensor histidine kinase/response regulator TorS  28.57 
 
 		 973 aa  300  8e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.374582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 		 866 aa  280  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 		 846 aa  271  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 1059 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2051  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.3 
 
 		 1007 aa  266  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.442026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 969 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  35.82 
 
 		 900 aa  261  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 1691 aa  260  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 		 1596 aa  257  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.29 
 
 		 743 aa  257  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  30.84 
 
 		 784 aa  257  8e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 		 817 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 973 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1350 aa  255  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 		 781 aa  253  9.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.96 
 
 		 1362 aa  253  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 1222 aa  252  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 		 717 aa  253  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 		 827 aa  252  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 1070 aa  251  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  38.74 
 
 		 758 aa  251  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 		 765 aa  251  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 957 aa  250  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 881 aa  250  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 		 695 aa  249  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 		 1127 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 		 1120 aa  249  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 984 aa  250  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 631 aa  249  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 		 1791 aa  249  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  40.41 
 
 		 641 aa  249  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  33.46 
 
 		 968 aa  249  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 1433 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 780 aa  249  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 		 969 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 1313 aa  248  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1767 aa  248  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 		 1767 aa  248  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 		 1398 aa  248  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  38.11 
 
 		 559 aa  248  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  32.66 
 
 		 751 aa  248  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  40.42 
 
 		 761 aa  247  8e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0202  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 		 781 aa  247  8e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 		 947 aa  247  9e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  35.93 
 
 		 1193 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  38.86 
 
 		 1040 aa  246  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  36.92 
 
 		 882 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 		 827 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 1055 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 1767 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 		 627 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  38.24 
 
 		 1125 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  38.32 
 
 		 982 aa  245  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 		 606 aa  245  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 724 aa  245  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 		 767 aa  244  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 		 843 aa  244  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 		 1075 aa  244  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 902 aa  244  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  37.14 
 
 		 544 aa  244  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 		 667 aa  244  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 738 aa  244  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 		 1310 aa  244  7e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 923 aa  244  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 		 647 aa  243  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 785 aa  243  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 932 aa  243  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>