More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0996 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.46 
 
 		 1440 aa  702    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  100 
 
 		 998 aa  2063    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.38 
 
 		 1117 aa  640    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  44.68 
 
 		 1329 aa  783    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  44.15 
 
 		 1328 aa  766    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  40.7 
 
 		 1432 aa  682    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  39.3 
 
 		 1472 aa  657    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  39.25 
 
 		 1450 aa  654    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  42.13 
 
 		 1035 aa  761    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.46 
 
 		 1440 aa  702    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  39.62 
 
 		 1441 aa  677    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.28 
 
 		 1124 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.5 
 
 		 1176 aa  610  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  37.53 
 
 		 1025 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  37.47 
 
 		 1429 aa  593  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.97 
 
 		 891 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  37.6 
 
 		 1942 aa  582  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.2 
 
 		 1331 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  44.05 
 
 		 717 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.86 
 
 		 1248 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.53 
 
 		 1891 aa  560  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.19 
 
 		 1975 aa  562  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  35.45 
 
 		 946 aa  561  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.15 
 
 		 2068 aa  546  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.03 
 
 		 1855 aa  528  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  37.11 
 
 		 991 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  35.73 
 
 		 1062 aa  506  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  35.06 
 
 		 2156 aa  486  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  28.71 
 
 		 655 aa  296  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  29.8 
 
 		 1136 aa  291  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  31.04 
 
 		 1043 aa  290  7e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  28.3 
 
 		 655 aa  289  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  30.22 
 
 		 852 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  30.07 
 
 		 850 aa  265  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  29.78 
 
 		 852 aa  262  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  29.78 
 
 		 852 aa  262  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  30.09 
 
 		 852 aa  262  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  30.55 
 
 		 848 aa  260  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  27.02 
 
 		 843 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  30.79 
 
 		 647 aa  255  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  27.3 
 
 		 899 aa  249  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  27.54 
 
 		 843 aa  247  6.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  29.75 
 
 		 1064 aa  246  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  29.46 
 
 		 874 aa  244  7e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  31.28 
 
 		 848 aa  244  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  26.8 
 
 		 842 aa  243  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  26.32 
 
 		 640 aa  243  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  30.88 
 
 		 852 aa  241  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  29.28 
 
 		 1064 aa  241  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  30.97 
 
 		 856 aa  239  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  27.76 
 
 		 2638 aa  234  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  30.63 
 
 		 852 aa  233  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29.98 
 
 		 1888 aa  224  6e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  26.11 
 
 		 841 aa  224  8e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  28.64 
 
 		 601 aa  218  4e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  26.95 
 
 		 713 aa  213  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  26.49 
 
 		 713 aa  210  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  26.49 
 
 		 713 aa  210  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  26.34 
 
 		 713 aa  209  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  27.47 
 
 		 712 aa  209  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  26.23 
 
 		 713 aa  209  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  26.85 
 
 		 713 aa  208  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  26.69 
 
 		 713 aa  207  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  26.38 
 
 		 713 aa  205  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  26.61 
 
 		 713 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  28.09 
 
 		 640 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  28.18 
 
 		 928 aa  201  7.999999999999999e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  26.92 
 
 		 669 aa  200  9e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  25.54 
 
 		 713 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  32.3 
 
 		 825 aa  197  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  30.14 
 
 		 718 aa  189  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  25.95 
 
 		 766 aa  180  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  26.05 
 
 		 1252 aa  169  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  23.08 
 
 		 776 aa  145  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  24.06 
 
 		 729 aa  101  9e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  23.09 
 
 		 715 aa  99.8  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  24.11 
 
 		 711 aa  98.2  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  23.31 
 
 		 693 aa  97.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  25.83 
 
 		 727 aa  96.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2363  glycogen debranching enzyme GlgX  25.11 
 
 		 701 aa  97.1  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0149674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  26.17 
 
 		 701 aa  95.9  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  22.46 
 
 		 694 aa  95.5  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1695  pullulanase-like glycosidase  31.64 
 
 		 846 aa  95.1  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.195322  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01253  glycogen debranching enzyme GlgX  23.15 
 
 		 695 aa  93.2  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.358953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  22.89 
 
 		 677 aa  92  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  20.55 
 
 		 718 aa  91.7  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09570  glycogen debranching enzyme GlgX  32.85 
 
 		 732 aa  90.5  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213931  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  25.25 
 
 		 711 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  27.02 
 
 		 721 aa  90.9  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  25.15 
 
 		 721 aa  90.9  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  30.15 
 
 		 708 aa  90.9  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  24.75 
 
 		 718 aa  90.5  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14831  putative isoamylase  23.18 
 
 		 668 aa  90.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451746  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  32.2 
 
 		 711 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  25.53 
 
 		 729 aa  89  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  32.2 
 
 		 711 aa  89  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  32.71 
 
 		 707 aa  89  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  29.65 
 
 		 706 aa  88.2  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  23.66 
 
 		 776 aa  88.2  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1103  glycogen debranching enzyme GlgX  21.73 
 
 		 695 aa  87.8  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.512458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>