More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1317 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  564  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  98.61 
 
 		 287 aa  558  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  44.41 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  44.06 
 
 		 288 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  44.06 
 
 		 288 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  43.9 
 
 		 295 aa  229  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  42.16 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  42.16 
 
 		 297 aa  228  9e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.24 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.49 
 
 		 291 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  30.66 
 
 		 284 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  28.72 
 
 		 281 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  31.39 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  28.72 
 
 		 281 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  28.72 
 
 		 281 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  31.99 
 
 		 292 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  30.11 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  31.62 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 		 277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  31.95 
 
 		 292 aa  118  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  31.52 
 
 		 334 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  28.97 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  28.97 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  28.72 
 
 		 324 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  28.22 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  30.1 
 
 		 331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  27.8 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  28.07 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  28.07 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.48 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  28.78 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  26.46 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  27.24 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  28.08 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  30.53 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  30.48 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.51 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  25.52 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  30.92 
 
 		 296 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  26.21 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  28.16 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  25.68 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  29.79 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  31.01 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  27.46 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  27.21 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  31.14 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  25.37 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  25.78 
 
 		 302 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  32.44 
 
 		 296 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  23.21 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 297 aa  92  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  26.36 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  26.36 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  26.36 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.6 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 316 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  29.29 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  29.37 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  29.33 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  27.93 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  30 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  26.39 
 
 		 299 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  26.89 
 
 		 313 aa  89.4  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  27.24 
 
 		 338 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  31.32 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  27.59 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  26.24 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  30.47 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  28.04 
 
 		 297 aa  86.3  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  24.1 
 
 		 314 aa  86.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  25.91 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  30.32 
 
 		 288 aa  85.5  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  25.89 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  28.07 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  28.99 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  24.65 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  25.75 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  24.74 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  28.27 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  24.62 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  25.62 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  28.67 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  25.62 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  28.72 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  26.43 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.9 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  28.08 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  25.18 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  24.83 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  26.44 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  27.76 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  26.21 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  27.18 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>