More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC02380 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC02380  nuclear matrix protein NMP200, putative  100 
 
 
507 aa  1034    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30495  predicted protein  39.56 
 
 
478 aa  322  9.999999999999999e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06906  cell cycle control protein (Cwf8), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13510)  36.9 
 
 
475 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.743736 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85107  predicted protein  31.55 
 
 
514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.1 
 
 
1652 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.9 
 
 
677 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 
1481 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.1 
 
 
1831 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  31.71 
 
 
484 aa  105  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  31.42 
 
 
696 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.96 
 
 
1163 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.12 
 
 
576 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  28.91 
 
 
1789 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  27.83 
 
 
1510 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  27.74 
 
 
1454 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.52 
 
 
1357 aa  99.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.47 
 
 
1236 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.63 
 
 
1221 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.58 
 
 
1240 aa  98.2  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24.56 
 
 
1193 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  27.47 
 
 
657 aa  97.8  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.71 
 
 
1363 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  27.62 
 
 
443 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  30.9 
 
 
1213 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.35 
 
 
1711 aa  97.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  26.36 
 
 
1247 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  27.74 
 
 
1523 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  25.77 
 
 
1474 aa  96.7  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  30.66 
 
 
1196 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  29.89 
 
 
947 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  29.37 
 
 
1217 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.2 
 
 
930 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  29.78 
 
 
742 aa  93.6  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  26.12 
 
 
1242 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27.09 
 
 
1807 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.5 
 
 
740 aa  91.3  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05530  RNA processing-related protein, putative  30.87 
 
 
511 aa  91.3  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104569  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  28.47 
 
 
1491 aa  90.9  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 
687 aa  90.5  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  27.6 
 
 
1188 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30.65 
 
 
1190 aa  90.1  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  27.17 
 
 
778 aa  90.1  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.41 
 
 
1262 aa  89.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.79 
 
 
1868 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  27.37 
 
 
505 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.21 
 
 
676 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.51 
 
 
1599 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.02 
 
 
698 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  24.32 
 
 
578 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.59 
 
 
630 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.57 
 
 
1188 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  22.93 
 
 
1552 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.08 
 
 
642 aa  87.4  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.79 
 
 
596 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.4 
 
 
682 aa  87.4  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.05 
 
 
1686 aa  86.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  30.43 
 
 
1209 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24 
 
 
664 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.24 
 
 
1553 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 
692 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.11 
 
 
1823 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46672  WD repeat protein  30.31 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06217  F-box and WD repeat-containing protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12060)  27.05 
 
 
618 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.824291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.06 
 
 
608 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  26.22 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.33 
 
 
1267 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  32.58 
 
 
1280 aa  84.7  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01468  pre-mRNA splicing factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04590)  24.06 
 
 
521 aa  84.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559626  hitchhiker  0.00529797 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  26.76 
 
 
782 aa  84  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  29.58 
 
 
928 aa  84  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  29.1 
 
 
872 aa  84  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.89 
 
 
1557 aa  84  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  30.62 
 
 
1484 aa  84  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  30.13 
 
 
1858 aa  83.6  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37533  predicted protein  25.08 
 
 
485 aa  82.4  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  28.85 
 
 
1443 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.88 
 
 
919 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  29.43 
 
 
1599 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.43 
 
 
792 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  25.69 
 
 
826 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  25.08 
 
 
1661 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.24 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.24 
 
 
1364 aa  80.5  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  26.76 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  28.57 
 
 
1901 aa  80.5  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  24.92 
 
 
1211 aa  80.1  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 
589 aa  80.1  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  23.08 
 
 
511 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  33.15 
 
 
954 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  28.48 
 
 
774 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  23.08 
 
 
1411 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.85 
 
 
1004 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.42 
 
 
1623 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43856  predicted protein  30.38 
 
 
476 aa  79.7  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.796398 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  27.7 
 
 
522 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 
728 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  27.76 
 
 
1214 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  27.58 
 
 
1656 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  31.71 
 
 
1208 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  27.2 
 
 
1183 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>