38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85107 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_85107  predicted protein  100 
 
 		 514 aa  1050    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06906  cell cycle control protein (Cwf8), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13510)  29.94 
 
 		 475 aa  196  8.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.743736 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30495  predicted protein  29.03 
 
 		 478 aa  179  9e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02380  nuclear matrix protein NMP200, putative  31.55 
 
 		 507 aa  172  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37533  predicted protein  29.69 
 
 		 485 aa  62.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  26.74 
 
 		 1344 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  23.12 
 
 		 1427 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42170  predicted protein  24.84 
 
 		 627 aa  50.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00994835 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43856  predicted protein  27.78 
 
 		 476 aa  50.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.796398 
 
 
-
 
NC_006686  CND05530  RNA processing-related protein, putative  28.46 
 
 		 511 aa  48.5  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104569  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  25.95 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  37.1 
 
 		 742 aa  48.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  25 
 
 		 522 aa  47.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  32.31 
 
 		 1157 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  24.56 
 
 		 1152 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25666  predicted protein  23 
 
 		 885 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  25.19 
 
 		 574 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.59 
 
 		 1652 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  28.3 
 
 		 344 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25.5 
 
 		 1188 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.34 
 
 		 1213 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  25 
 
 		 774 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03026  Coatomer alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59946]  26.83 
 
 		 1205 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.21 
 
 		 1163 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  28.3 
 
 		 344 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  30.36 
 
 		 1279 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.36 
 
 		 434 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  29.51 
 
 		 1247 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.26 
 
 		 1262 aa  44.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.05 
 
 		 1004 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.86 
 
 		 622 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  30.36 
 
 		 1279 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  27.59 
 
 		 778 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2935  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 		 403 aa  43.9  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0731745  hitchhiker  0.00134562 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.9 
 
 		 682 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01468  pre-mRNA splicing factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04590)  26.83 
 
 		 521 aa  43.5  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559626  hitchhiker  0.00529797 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  27.27 
 
 		 564 aa  43.5  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  28.1 
 
 		 696 aa  43.5  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>