More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1021 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1021  rhomboid family protein  100 
 
 		 172 aa  333  5.999999999999999e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0537483  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0786  rhomboid family protein  98.84 
 
 		 172 aa  329  1e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.169699  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1083  rhomboid family protein  97.67 
 
 		 172 aa  325  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400512  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0732  conserved hypothetical integral membrane protein, Rhomboid family  62.92 
 
 		 176 aa  216  2e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000749647  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0883  rhomboid family protein  54.91 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0917  rhomboid family protein  55.76 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1090  rhomboid family protein  56.38 
 
 		 184 aa  164  5e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1263  peptidase E  43.43 
 
 		 191 aa  121  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  33.78 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  32.11 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  34.69 
 
 		 342 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  33.59 
 
 		 625 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  31.94 
 
 		 554 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  34.01 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  33.07 
 
 		 625 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.07 
 
 		 625 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  33.07 
 
 		 625 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  34.75 
 
 		 486 aa  67.8  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  34.67 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  34.19 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  31.32 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  30.56 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  33.12 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  32.56 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  32.68 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  34.3 
 
 		 279 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  32.33 
 
 		 547 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  30.13 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  35.47 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  30.71 
 
 		 625 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  32.21 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  32.48 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  32.43 
 
 		 519 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  39.13 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  29.88 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  33.58 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  30.11 
 
 		 487 aa  62.4  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  30.11 
 
 		 487 aa  62.4  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  29.34 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  33.08 
 
 		 226 aa  62  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  33.55 
 
 		 239 aa  62  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  40.91 
 
 		 306 aa  62  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  32.37 
 
 		 569 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  27.84 
 
 		 360 aa  61.6  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  31.43 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  33.56 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  33.1 
 
 		 327 aa  61.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  32.56 
 
 		 541 aa  60.8  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  32.56 
 
 		 541 aa  60.8  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03550  peptidase, S54 (rhomboid) family  28.76 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  29.34 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2325  rhomboid family protein  34.35 
 
 		 246 aa  60.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.555664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  29.45 
 
 		 237 aa  60.8  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  38.83 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  34.41 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  32.69 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  29.8 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  39.18 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1088  Rhomboid family protein  32 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  31.03 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  35.07 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  28.92 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  31.03 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  33.59 
 
 		 511 aa  60.1  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  36.88 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  37.93 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  39.53 
 
 		 523 aa  58.9  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  31.37 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07075  rhomboid family protein  39.68 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  33.57 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  30 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  29.22 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  33.57 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  33.57 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  34.04 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  27.85 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  42.53 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  34.27 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  29.22 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  40.23 
 
 		 303 aa  57  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  31.41 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  35.71 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  31.76 
 
 		 264 aa  57  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  26.51 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  35.58 
 
 		 251 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  38.71 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  33.04 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  35.96 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  29.09 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  34.56 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  31.62 
 
 		 525 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  26.29 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  31.37 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  37.11 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  30.66 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  28 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  32.68 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  32.89 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  29.14 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>