More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1633 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1633  FlmA  100 
 
 		 331 aa  686    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0560  polysaccharide biosynthesis protein  79.88 
 
 		 328 aa  559  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2208  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  76.9 
 
 		 329 aa  541  1e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0535487  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1485  polysaccharide biosynthesis protein  77.99 
 
 		 334 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.317262  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0429  polysaccharide biosynthesis protein  77.99 
 
 		 334 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1310  polysaccharide biosynthesis protein  77.04 
 
 		 334 aa  514  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.573218  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1298  UDP-GlcNAc C6-dehydratase/C4-reductase  72.84 
 
 		 335 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0609  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  66.05 
 
 		 333 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.812779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3011  polysaccharide biosynthesis protein CapD  63.19 
 
 		 331 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2629  polysaccharide biosynthesis protein CapD  66.46 
 
 		 331 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02896  polysaccharide biosynthesis protein  64.53 
 
 		 332 aa  449  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1518  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.07 
 
 		 333 aa  448  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3711  polysaccharide biosynthesis protein CapD  61.42 
 
 		 333 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.724189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1302  polysaccharide biosynthesis protein  65.44 
 
 		 331 aa  448  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0093  polysaccharide biosynthesis protein CapD  64.91 
 
 		 333 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  64.91 
 
 		 333 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.437109  normal  0.427053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3271  polysaccharide biosynthesis protein  65.83 
 
 		 331 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3560  polysaccharide biosynthesis protein CapD  65.2 
 
 		 331 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.423862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0580  polysaccharide biosynthesis protein CapD  64.89 
 
 		 333 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2409  polysaccharide biosynthesis protein CapD  62.61 
 
 		 344 aa  441  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.551754  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1396  polysaccharide biosynthesis protein CapD  66.14 
 
 		 331 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.709485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2967  polysaccharide biosynthesis protein CapD  66.14 
 
 		 331 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1286  polysaccharide biosynthesis protein CapD  64.83 
 
 		 331 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1318  polysaccharide biosynthesis protein CapD  65.52 
 
 		 332 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.914837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0679  polysaccharide biosynthesis protein CapD  61.47 
 
 		 333 aa  431  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.122561  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3080  polysaccharide biosynthesis protein CapD  61.16 
 
 		 332 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4634  polysaccharide biosynthesis protein CapD  59.16 
 
 		 344 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1193  polysaccharide biosynthesis protein CapD  60.63 
 
 		 333 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.965289  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0643  Short-chain dehydrogenase/reductase  59.68 
 
 		 333 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.132994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1957  polysaccharide biosynthesis protein CapD  57.45 
 
 		 357 aa  391  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  57.54 
 
 		 350 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0778  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.08 
 
 		 325 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0653  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.29 
 
 		 332 aa  376  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0235558  normal  0.660633 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2322  polysaccharide biosynthesis protein CapD  54.24 
 
 		 332 aa  374  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1199  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.19 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01570  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  51.83 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3032  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  54.22 
 
 		 332 aa  368  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2421  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.96 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0458  polysaccharide biosynthesis protein CapD  55.29 
 
 		 342 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1142  nucleoside-diphosphate sugar epimerase  53.75 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13073  capsular polysaccharide biosynthesis protein  54.22 
 
 		 336 aa  360  1e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2766  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase; UDP-4-dehydro-6-deoxy-2-acetamido-D-glucose 4-reductase  54.6 
 
 		 338 aa  355  5e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4262  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  54.85 
 
 		 338 aa  354  8.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3090  polysaccharide biosynthesis protein CapD  52.6 
 
 		 326 aa  353  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.196445  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3947  polysaccharide biosynthesis protein CapD  54.57 
 
 		 340 aa  352  7e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.689942  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1385  polysaccharide biosynthesis protein CapD  53.13 
 
 		 337 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862014 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2092  polysaccharide biosynthesis protein  52.98 
 
 		 337 aa  340  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0101  capsular polysaccharide biosynthesis protein  51.37 
 
 		 339 aa  322  4e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0202415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3221  polysaccharide biosynthesis protein CapD  48.12 
 
 		 335 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0146  polysaccharide biosynthesis protein CapD  49.47 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000342824 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1591  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.77 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0428  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.36 
 
 		 343 aa  259  4e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0374599  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0227  polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.14 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3520  polysaccharide biosynthesis protein CapD  47.24 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2232  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.29 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1447  UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase  46.21 
 
 		 328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193449 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1471  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.57 
 
 		 341 aa  245  6e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3851  FlmA  46.21 
 
 		 328 aa  245  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0147  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.84 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.886918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1621  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.51 
 
 		 338 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2246  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  40.66 
 
 		 336 aa  239  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0501  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.61 
 
 		 330 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1672  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.52 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3715  polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.19 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.722931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1283  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.3 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1980  polysaccharide biosynthesis protein  39.16 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3511  UDP-glucose 4-epimerase  46.13 
 
 		 336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000024389 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1718  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.84 
 
 		 341 aa  236  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.910405  hitchhiker  0.0000000304233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1373  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.1 
 
 		 344 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45387  hitchhiker  0.00458395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1872  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.58 
 
 		 336 aa  235  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0726  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  44.44 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0748  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.88 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3026  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.14 
 
 		 350 aa  229  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0139  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.69 
 
 		 342 aa  228  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0144  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.69 
 
 		 342 aa  228  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3504  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.94 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0138  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.06 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0558  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.86 
 
 		 340 aa  226  6e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.201229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3033  polysaccharide biosynthesis protein CapD  43.33 
 
 		 340 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0789  fused dTDP-4-dehydrorhamnose reductase and 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  39.58 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468733  hitchhiker  0.00205032 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1109  polysaccharide biosynthesis protein CapD  42.5 
 
 		 341 aa  223  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.99 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0201234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4310  polysaccharide biosynthesis protein CapD  41.7 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1660  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.21 
 
 		 350 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5444  FlmA  44.07 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3801  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.14 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18620  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  42.4 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1480  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.39 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  normal  0.282035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2741  polysaccharide biosynthesis protein CapD  38.66 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1302  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.96 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.454328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2184  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.61 
 
 		 404 aa  212  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4753  polysaccharide biosynthesis protein CapD  40.85 
 
 		 345 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.447789  normal  0.0884742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0761  UDP-glucose 4-epimerase  44.01 
 
 		 348 aa  208  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4586  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.89 
 
 		 348 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.789975  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0117  polysaccharide biosynthesis protein CapD  39.18 
 
 		 335 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000592797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0020  polysaccharide biosynthesis protein CapD  36.92 
 
 		 353 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2650  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.06 
 
 		 607 aa  180  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3919  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.33 
 
 		 652 aa  172  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1702  polysaccharide biosynthesis protein CapD  34.98 
 
 		 680 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2334  polysaccharide biosynthesis protein CapD  35.86 
 
 		 614 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>