86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0672 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  474  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  80.69 
 
 
235 aa  362  2e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  61.8 
 
 
237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  58.37 
 
 
238 aa  275  6e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  57.51 
 
 
238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  57.51 
 
 
238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  56.65 
 
 
239 aa  267  1e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  58.37 
 
 
234 aa  263  1e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  55.7 
 
 
239 aa  257  1e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  46.58 
 
 
237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  26.05 
 
 
238 aa  85.5  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  28.26 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  28.51 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  25.71 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  26.12 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  27.35 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  26.89 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  26.92 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  25.42 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  27.13 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  30.26 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  26.27 
 
 
244 aa  72  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  25.11 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1543  protein of unknown function DUF164  25.11 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.110015  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  22.52 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  24.69 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1806  hypothetical protein  27.39 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177003  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  24.79 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2044  hypothetical protein  31.25 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000109499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0026  protein of unknown function DUF164  26.56 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171339  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  29.29 
 
 
116 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  24.45 
 
 
254 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  25.44 
 
 
259 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07836  hypothetical protein  24.14 
 
 
261 aa  62.8  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  23.65 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  22.58 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0677  hypothetical protein  25 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  27.78 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  24.49 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  24.49 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  23.42 
 
 
247 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  25.63 
 
 
251 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0234  hypothetical protein  24.23 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  25.52 
 
 
275 aa  56.2  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  29.67 
 
 
249 aa  55.5  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  28.11 
 
 
248 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  27.04 
 
 
246 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  19.74 
 
 
247 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  22.41 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  24.08 
 
 
262 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1501  protein of unknown function DUF164  31.36 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326632  normal  0.79734 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1111  hypothetical protein  23.32 
 
 
266 aa  52  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  23.61 
 
 
1621 aa  50.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  25 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  25 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  25.18 
 
 
245 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  25.42 
 
 
240 aa  48.9  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  27.23 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  26.53 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  28.33 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  21.95 
 
 
247 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  21.55 
 
 
245 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  24.39 
 
 
244 aa  45.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1350  hypothetical protein  26.67 
 
 
266 aa  46.2  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000660236  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  19.51 
 
 
247 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  19.42 
 
 
245 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  21.9 
 
 
245 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  19.42 
 
 
245 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  19.42 
 
 
245 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1726  hypothetical protein  24.11 
 
 
266 aa  45.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1840  protein of unknown function DUF164  22.81 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.283668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  24.06 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  19.57 
 
 
2228 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  28.57 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0030  protein of unknown function DUF164  23.35 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372123  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  20.73 
 
 
253 aa  42.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0989  Chromosome segregation ATPase-like protein  25.32 
 
 
818 aa  42.4  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.545373  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  21.52 
 
 
239 aa  42.4  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1555  protein of unknown function DUF164  24.74 
 
 
266 aa  42.4  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111812  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1650  protein of unknown function DUF164  27.54 
 
 
265 aa  42.4  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000697744  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  22.58 
 
 
245 aa  42  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0974  protein of unknown function DUF164  27.78 
 
 
268 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1325  hypothetical protein  30.77 
 
 
783 aa  42  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.2486 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.27 
 
 
1214 aa  42  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  20.79 
 
 
238 aa  41.6  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00317  EF hand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02540)  23.12 
 
 
1258 aa  41.6  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>