More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1735 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1735  transketolase  100 
 
 		 636 aa  1306    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00492424  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0069  transketolase  77.99 
 
 		 636 aa  1040    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.874951  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  68.78 
 
 		 632 aa  875    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  68.78 
 
 		 632 aa  875    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  68.55 
 
 		 636 aa  939    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0338  transketolase  61.56 
 
 		 639 aa  796    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.025251  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  69.45 
 
 		 634 aa  910    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  68.46 
 
 		 632 aa  869    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  66.24 
 
 		 656 aa  877    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  73.74 
 
 		 633 aa  971    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  46.39 
 
 		 666 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  46.39 
 
 		 666 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  46.39 
 
 		 666 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  45.51 
 
 		 668 aa  569  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  45.05 
 
 		 684 aa  566  1e-160  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  45.78 
 
 		 666 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  45.38 
 
 		 653 aa  560  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  47.35 
 
 		 697 aa  560  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  46.09 
 
 		 671 aa  558  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  45.66 
 
 		 666 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  45.51 
 
 		 666 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  45.66 
 
 		 666 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  44.44 
 
 		 668 aa  558  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  46.19 
 
 		 676 aa  558  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  45.09 
 
 		 711 aa  556  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  46.19 
 
 		 676 aa  558  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  46.46 
 
 		 662 aa  554  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  45.36 
 
 		 666 aa  554  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  45.21 
 
 		 666 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  45.51 
 
 		 666 aa  554  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  47.53 
 
 		 679 aa  552  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  45.36 
 
 		 680 aa  555  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  45.51 
 
 		 666 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  44.78 
 
 		 711 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  45.51 
 
 		 680 aa  555  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  45.43 
 
 		 668 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  45.85 
 
 		 665 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  45.01 
 
 		 688 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  45.21 
 
 		 667 aa  545  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  44.75 
 
 		 666 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  45.72 
 
 		 682 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  46.4 
 
 		 665 aa  541  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  44.33 
 
 		 664 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  45.21 
 
 		 666 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2601  transketolase  47.45 
 
 		 668 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000100411  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  44.68 
 
 		 671 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1311  transketolase  45.35 
 
 		 654 aa  536  1e-151  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  45.15 
 
 		 665 aa  538  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  45.65 
 
 		 672 aa  536  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  45.65 
 
 		 668 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  45 
 
 		 665 aa  538  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  43.22 
 
 		 691 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  43.22 
 
 		 691 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  45.99 
 
 		 667 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02318  hypothetical protein  45.99 
 
 		 667 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  45.99 
 
 		 667 aa  533  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  45.99 
 
 		 667 aa  532  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  45.99 
 
 		 667 aa  533  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  45.99 
 
 		 667 aa  533  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  45.99 
 
 		 667 aa  533  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  45.84 
 
 		 667 aa  531  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  44.49 
 
 		 664 aa  530  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  45.25 
 
 		 665 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2023  transketolase  44.74 
 
 		 655 aa  531  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.98963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  45.4 
 
 		 665 aa  529  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00940  conserved hypothetical protein  41.9 
 
 		 687 aa  526  1e-148  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.292242  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  44.86 
 
 		 665 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  44.34 
 
 		 723 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  44.01 
 
 		 666 aa  528  1e-148  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3263  hypothetical protein  44.65 
 
 		 663 aa  526  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.415108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  44.14 
 
 		 673 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  46.51 
 
 		 660 aa  528  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  46.41 
 
 		 667 aa  528  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00688  transketolase TktA (AFU_orthologue; AFUA_1G13500)  43.88 
 
 		 684 aa  522  1e-147  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0372185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  44.56 
 
 		 664 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  44.33 
 
 		 664 aa  525  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  44.56 
 
 		 664 aa  523  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  43.87 
 
 		 665 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  45.02 
 
 		 661 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  44.56 
 
 		 664 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  43.67 
 
 		 691 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  45.48 
 
 		 660 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  43.23 
 
 		 671 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  45.69 
 
 		 664 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  43.16 
 
 		 671 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  44.19 
 
 		 665 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  45.54 
 
 		 664 aa  522  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2707  transketolase  44.78 
 
 		 666 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  45.03 
 
 		 665 aa  519  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  43.23 
 
 		 671 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  44.56 
 
 		 664 aa  521  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  44.81 
 
 		 674 aa  519  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  44.34 
 
 		 662 aa  520  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  45.39 
 
 		 664 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  43.96 
 
 		 663 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  44.93 
 
 		 664 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  45.12 
 
 		 668 aa  517  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2405  transketolase  43.16 
 
 		 682 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  42.95 
 
 		 655 aa  517  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0876  transketolase  45.11 
 
 		 663 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>