237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11438 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  100 
 
 		 381 aa  775    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  39.91 
 
 		 459 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  33.77 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  28.06 
 
 		 410 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  30.77 
 
 		 425 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  29.67 
 
 		 371 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  30.5 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.38 
 
 		 369 aa  169  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  31.51 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.33 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  29.92 
 
 		 394 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  30.56 
 
 		 384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  30.03 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.22 
 
 		 385 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  28.84 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1117 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  29.23 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2514  PepSY-associated TM helix domain protein  29.37 
 
 		 437 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.49 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  27.11 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  34.95 
 
 		 482 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  27.75 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  25.82 
 
 		 381 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.56 
 
 		 849 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.01 
 
 		 850 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07035  putative iron-regulated transmembrane protein  28.46 
 
 		 377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  25.7 
 
 		 397 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.13 
 
 		 850 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.93 
 
 		 851 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  25.4 
 
 		 783 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  25.54 
 
 		 381 aa  126  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.55 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.54 
 
 		 842 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.68 
 
 		 843 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  28.53 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  23.56 
 
 		 850 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  26.61 
 
 		 362 aa  112  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.33 
 
 		 885 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  23.14 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  22.57 
 
 		 844 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  23.84 
 
 		 850 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.37 
 
 		 398 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4883  hypothetical protein  26.25 
 
 		 379 aa  106  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  22.75 
 
 		 398 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.59 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4916  PepSY-associated TM helix domain protein  24.59 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2094  putative bifunctional protein: sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component; iron-uptake factor  24.87 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  23.67 
 
 		 840 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.74 
 
 		 849 aa  97.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.81 
 
 		 892 aa  96.7  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  22.03 
 
 		 380 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  22.03 
 
 		 380 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  23.61 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  23.58 
 
 		 822 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  20.76 
 
 		 393 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.78 
 
 		 403 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  21.3 
 
 		 455 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  21.55 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  23.31 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5168  PepSY-associated TM helix domain protein  22.97 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  23.22 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  22.03 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.1 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  21.94 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  20.85 
 
 		 455 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.08 
 
 		 840 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.68 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  21.8 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  21.05 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  23.66 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  22.05 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  20.49 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  23.12 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  20.05 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  20.45 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  26.92 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  21.27 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.02 
 
 		 533 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  20.77 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  22.51 
 
 		 487 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  21.16 
 
 		 844 aa  71.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  21.05 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.98 
 
 		 530 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3413  hypothetical protein  24.27 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.45 
 
 		 530 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.87 
 
 		 389 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.37 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  22.64 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.77 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  21.62 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  22.6 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  21.56 
 
 		 521 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  22.51 
 
 		 506 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2076  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.68 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.02 
 
 		 539 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  21.95 
 
 		 496 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4367  PepSY-associated TM helix domain protein  21.07 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0495183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  21.24 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  20.6 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04986  hypothetical protein  20.7 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>