More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2511 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2511  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 396 aa  788    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.751343  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2512  OmpC family outer membrane porin  71.83 
 
 		 329 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.127699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  59.09 
 
 		 389 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  58.33 
 
 		 389 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0299  OmpC family outer membrane porin  47.06 
 
 		 391 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.882508 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  44.94 
 
 		 390 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  44.55 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  44.55 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  47.78 
 
 		 389 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  44.31 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  47.78 
 
 		 389 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  45.91 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  45.66 
 
 		 385 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  45.07 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  44.12 
 
 		 389 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  45.07 
 
 		 436 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  45.07 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  45.07 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  45.07 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  45.07 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  45.07 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.83 
 
 		 386 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  45.27 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  45.27 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  44.78 
 
 		 383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  45.3 
 
 		 383 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  42.65 
 
 		 396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  44.63 
 
 		 391 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  46.32 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  41.22 
 
 		 422 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  41.87 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  43.8 
 
 		 395 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  40.05 
 
 		 391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  41.65 
 
 		 398 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  41.52 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  39.42 
 
 		 408 aa  250  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  41.03 
 
 		 400 aa  249  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  39.9 
 
 		 400 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  43.64 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  40.2 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  39.13 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  39.13 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  39.13 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  39.13 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  39.13 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  40.05 
 
 		 421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  40.05 
 
 		 421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  40.54 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  40.05 
 
 		 397 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  37.35 
 
 		 386 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  40.05 
 
 		 397 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  39.42 
 
 		 397 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  39.49 
 
 		 409 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  39.51 
 
 		 397 aa  232  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  37.91 
 
 		 386 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  40.46 
 
 		 352 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  39.42 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  43.17 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  39.45 
 
 		 391 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  37.98 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  39.95 
 
 		 445 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  37.59 
 
 		 393 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  39.61 
 
 		 386 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  37.84 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  39.66 
 
 		 414 aa  222  9e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  38.31 
 
 		 408 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  39.18 
 
 		 384 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  39.18 
 
 		 384 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  39.18 
 
 		 384 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  39.18 
 
 		 384 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  37.32 
 
 		 409 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  39.18 
 
 		 384 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  39.18 
 
 		 384 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  38.24 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  39.18 
 
 		 384 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  37.32 
 
 		 409 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1030  OmpC family outer membrane porin  38.78 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00011605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  37.89 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  38.42 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  38.29 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  38.94 
 
 		 403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  38.94 
 
 		 403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  40.31 
 
 		 384 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  39.15 
 
 		 387 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  38.65 
 
 		 383 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  40.31 
 
 		 384 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  38.94 
 
 		 398 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  40.31 
 
 		 384 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  40.31 
 
 		 384 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  40.31 
 
 		 411 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  37.22 
 
 		 375 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  37.22 
 
 		 375 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  40.31 
 
 		 430 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  40.31 
 
 		 430 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  37.08 
 
 		 383 aa  215  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  37.38 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  39.15 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  38.83 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  37.56 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  37.22 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>