More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0299 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0299  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 391 aa  784    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.882508 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  56.3 
 
 		 390 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  56.56 
 
 		 390 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  56.56 
 
 		 390 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  54.45 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  47.27 
 
 		 389 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2511  OmpC family outer membrane porin  47.45 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.751343  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  46.23 
 
 		 389 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  42.03 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  40 
 
 		 422 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  42.97 
 
 		 389 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  40.85 
 
 		 436 aa  252  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  42.49 
 
 		 389 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  41.1 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  41.1 
 
 		 436 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  41.1 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  41.1 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  41.1 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  41.1 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  40.91 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  40.85 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2512  OmpC family outer membrane porin  44.11 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.127699 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  40.29 
 
 		 393 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  40.4 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  40.16 
 
 		 389 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  41 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  41.63 
 
 		 400 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  41.16 
 
 		 385 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  40.91 
 
 		 385 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  42.28 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  40.39 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  40.91 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  38.89 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  39.35 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  39.35 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  40.91 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  39.35 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  39.62 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  39.35 
 
 		 384 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  40.51 
 
 		 383 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  39.62 
 
 		 430 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  39.62 
 
 		 430 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  42.41 
 
 		 403 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  38.27 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  36.63 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  39.65 
 
 		 383 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  38.72 
 
 		 409 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  38.24 
 
 		 386 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  38.21 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  39.14 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  37.74 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  39.84 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  39.84 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  39.84 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  36.68 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  39.84 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  39.84 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  39.84 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  39.84 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  37.59 
 
 		 386 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  36.68 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  37.91 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  37.66 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  36.68 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  37.78 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  36.43 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  39.06 
 
 		 414 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  36.43 
 
 		 386 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  39.3 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  36.72 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  39.3 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  38.87 
 
 		 388 aa  222  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  37.96 
 
 		 394 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  39.9 
 
 		 391 aa  222  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  38.18 
 
 		 394 aa  222  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  38.4 
 
 		 393 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  36.43 
 
 		 381 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  39.02 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  38.31 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  39.79 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  40.21 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  36.34 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  36.34 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  36.78 
 
 		 391 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  36.34 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  36.34 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  37.06 
 
 		 381 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  38.1 
 
 		 409 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  40.63 
 
 		 390 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  40.63 
 
 		 390 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  38.5 
 
 		 387 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  39.25 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  37.23 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  36.1 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  39.28 
 
 		 390 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  36.86 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  39.84 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  38.38 
 
 		 384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0218  OmpC family outer membrane porin  39.53 
 
 		 392 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  39.9 
 
 		 381 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>