More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2142 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  64.36 
 
 		 313 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0496  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2197  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2342  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 312 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2847  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  0.325567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0119  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 316 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6120  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4752  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4203  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 329 aa  158  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2590  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 338 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2788  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1935  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2760  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.436538 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0354  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2357  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0418601  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5518  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2497  transcription regulator protein  32 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.82783  normal  0.625013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5291  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67170  LysR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8014  transcriptional regulator, LysR family  32.11 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5825  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4442  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  32.35 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4707  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1544  transcriptional regulator, LysR family  34.4 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2699  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.133782  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1998  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0067  LysR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3256  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.14149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4993  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0133249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4445  LysR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.400594 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.93 
 
 		 306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.18 
 
 		 311 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.93 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.31 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.93 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.41 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0571  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2546  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715041  normal  0.706169 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0224  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6146  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3464  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3109  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.129161 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3713  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 295 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0343753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1407  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 344 aa  132  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833584 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4387  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.48 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2069  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.156662 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  29.11 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.31 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.97 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0848  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4432  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3995  transcriptional regulator, LysR family  28.98 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.97 
 
 		 304 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  29.9 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1932  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.73 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0970  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.87 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0947  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2210  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.97 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3251  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.87 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000182985 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4369  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.536466  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1235  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1671  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1023  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.93 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0217  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0307  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  29 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.62 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>