49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0213 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  89.27 
 
 		 662 aa  1184    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  69.98 
 
 		 641 aa  917    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  100 
 
 		 660 aa  1336    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  39.2 
 
 		 661 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  40.37 
 
 		 655 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  40.06 
 
 		 652 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  35.93 
 
 		 663 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  35.56 
 
 		 659 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  39.08 
 
 		 668 aa  392  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  36 
 
 		 660 aa  388  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  35.13 
 
 		 659 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  36.8 
 
 		 674 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  36.49 
 
 		 663 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  34.35 
 
 		 661 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  36.09 
 
 		 662 aa  363  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  37.59 
 
 		 681 aa  358  9.999999999999999e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  36.75 
 
 		 720 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  34.5 
 
 		 659 aa  355  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  32.23 
 
 		 712 aa  354  2.9999999999999997e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  37.01 
 
 		 657 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  35.78 
 
 		 675 aa  343  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  36.96 
 
 		 672 aa  341  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  34.66 
 
 		 657 aa  340  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  34.66 
 
 		 657 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  35.52 
 
 		 678 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  35.52 
 
 		 678 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  30.99 
 
 		 672 aa  325  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  34.25 
 
 		 686 aa  319  9e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  31.41 
 
 		 672 aa  319  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  34.58 
 
 		 610 aa  317  5e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  33.86 
 
 		 687 aa  310  6.999999999999999e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  36.26 
 
 		 693 aa  310  8e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  35.75 
 
 		 693 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  35.63 
 
 		 692 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.17 
 
 		 659 aa  290  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  29.77 
 
 		 651 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  30.43 
 
 		 614 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  29.29 
 
 		 611 aa  244  5e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  32.91 
 
 		 565 aa  237  5.0000000000000005e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.19 
 
 		 656 aa  223  7e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  28.53 
 
 		 658 aa  222  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.34 
 
 		 651 aa  220  7e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  30 
 
 		 1433 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  26.03 
 
 		 1526 aa  109  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  26.18 
 
 		 1537 aa  107  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  25.93 
 
 		 1593 aa  95.9  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.59 
 
 		 751 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.62 
 
 		 725 aa  47  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  23.44 
 
 		 758 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>