More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2704 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  45.16 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3334  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  42.19 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4166  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.74 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.74 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.74 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 497 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  31.18 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5813  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393234  hitchhiker  0.00386056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  48.08 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  47.17 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.46 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.46 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  30.46 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.46 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.46 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.46 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  44.05 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>