157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3095 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3095  ribonuclease BN, putative  100 
 
 		 302 aa  588  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1606  putative ribonuclease BN  84.95 
 
 		 311 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.945482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3591  ribonuclease BN  65.16 
 
 		 311 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.595872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1764  ribonuclease BN  67.8 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1313  ribonuclease BN  67.92 
 
 		 300 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0115904  normal  0.255561 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5294  ribonuclease BN  67.46 
 
 		 300 aa  347  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2419  ribonuclease BN, putative  75.6 
 
 		 301 aa  345  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662765  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3981  ribonuclease BN, putative  59.32 
 
 		 301 aa  332  6e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0234  ribonuclease BN  59.93 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2719  ribonuclease BN  55 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0535  putative ribonuclease BN  47.84 
 
 		 329 aa  265  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2400  hypothetical protein  53.97 
 
 		 80 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  25.38 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  24 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  26.32 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  25 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  27.93 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  23.66 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  25.64 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  25.2 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  25.94 
 
 		 412 aa  59.3  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  30.04 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  24.08 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  35.06 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  26.34 
 
 		 538 aa  57  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  25.68 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  20.52 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  20.65 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3954  ribonuclease BN  22.91 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  24.03 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  25.93 
 
 		 411 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  23.43 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001900  ribonuclease BN  26.22 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.886374  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  22.18 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  23.81 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  25.56 
 
 		 411 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  25.8 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  25.18 
 
 		 451 aa  53.1  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  25.4 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  26.18 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  24.3 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  25.94 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  24.02 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  24.52 
 
 		 525 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  24.32 
 
 		 367 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  24.35 
 
 		 453 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  24.52 
 
 		 525 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2314  ribonuclease BN  24.9 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  23.99 
 
 		 446 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  23.19 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  30.34 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  24.05 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  34.29 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  29.03 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  25.71 
 
 		 499 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  24.6 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  23.26 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  25.55 
 
 		 439 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  23.6 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  24.81 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  22.56 
 
 		 397 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  23.62 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  23.62 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  23.62 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  23.62 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  24.65 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  23.62 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  24.62 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  23.62 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  29.59 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  29.59 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  27.69 
 
 		 320 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  34.78 
 
 		 447 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  28.24 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  28.24 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  28.24 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  28.24 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  26.92 
 
 		 445 aa  46.2  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 337 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1979  hypothetical protein  25 
 
 		 479 aa  46.2  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  25.08 
 
 		 375 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1521  ribonuclease BN  25.89 
 
 		 441 aa  45.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00169169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  23.05 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  22.88 
 
 		 446 aa  45.8  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0979  putative ribonuclease BN  24.44 
 
 		 282 aa  45.8  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  32.56 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  22.86 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  21.53 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  25.7 
 
 		 437 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  25.47 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  25 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  26.1 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  26.1 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  26.1 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  25.7 
 
 		 437 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  27.97 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  27.97 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  32.18 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>