78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1658 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 284 aa  557  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  89.08 
 
 		 284 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  61.64 
 
 		 295 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  63.88 
 
 		 280 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  68.72 
 
 		 280 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  60 
 
 		 275 aa  291  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  60 
 
 		 275 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  60 
 
 		 275 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  69.81 
 
 		 295 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  59.19 
 
 		 275 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  70.19 
 
 		 311 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  70.19 
 
 		 311 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  70.19 
 
 		 311 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  70.19 
 
 		 311 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  70.19 
 
 		 311 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  70.19 
 
 		 311 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  69.71 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  45.75 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  45.95 
 
 		 311 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  47.57 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.98 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.98 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  44.64 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  42.42 
 
 		 343 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.21 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.76 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  38.76 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 		 237 aa  96.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  30.97 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  34.3 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  29.55 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  29.03 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  32.45 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  29.23 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.78 
 
 		 563 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 409 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 1091 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 1092 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 607 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  36.08 
 
 		 1124 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 607 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0741  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 191 aa  45.8  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0811  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 139 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.5 
 
 		 2240 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 2262 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2910  hypothetical protein  31.06 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 605 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 607 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0854  Tetratricopeptide domain protein  34.19 
 
 		 122 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.679313  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2882  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.17 
 
 		 767 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4942  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 133 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00284868  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3977  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 716 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1278  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 429 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.7 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  33.09 
 
 		 607 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 607 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 607 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 1421 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 3145 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5176  family 2 glycosyl transferase  32.53 
 
 		 434 aa  42.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.634801  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 613 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.62 
 
 		 1022 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  26.12 
 
 		 781 aa  42.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  33.33 
 
 		 613 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  29.25 
 
 		 572 aa  42.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 208 aa  42.7  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0312  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 293 aa  42.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.542961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 468 aa  42.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  31.67 
 
 		 581 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 585 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  28.04 
 
 		 780 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 780 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0959  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 199 aa  42.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>