111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5920 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  100 
 
 
232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  71.12 
 
 
229 aa  331  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3032  glutamate synthase alpha subunit  65.52 
 
 
228 aa  290  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  63 
 
 
230 aa  286  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  61.67 
 
 
225 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  58.44 
 
 
236 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  58.77 
 
 
224 aa  259  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  57.89 
 
 
229 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  57.08 
 
 
227 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  56.64 
 
 
227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4805  glutamate synthase alpha subunit domain protein  56.14 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  54.15 
 
 
227 aa  248  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  56.95 
 
 
229 aa  249  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  56.95 
 
 
229 aa  248  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  58.77 
 
 
228 aa  248  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  55.02 
 
 
235 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1137  formyl-methanofuran dehydrogenase subunit C  58.15 
 
 
229 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  56.47 
 
 
227 aa  245  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2249  glutamate synthase alpha subunit  55.22 
 
 
224 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  56.14 
 
 
227 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4894  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  56.39 
 
 
238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4983  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  56.39 
 
 
238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5262  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  55.95 
 
 
238 aa  242  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  56.05 
 
 
225 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  54.63 
 
 
228 aa  241  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  58.74 
 
 
229 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  53.3 
 
 
228 aa  238  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3523  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  53.1 
 
 
242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0202692 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  52.19 
 
 
228 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  51.54 
 
 
228 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  50.66 
 
 
228 aa  228  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2633  glutamate synthase alpha subunit domain protein  55.41 
 
 
235 aa  224  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  34.72 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  32.03 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  29.44 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.42 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.72 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.94 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  25.93 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  31.78 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  24.22 
 
 
252 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.01 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  25.7 
 
 
248 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  29.55 
 
 
289 aa  62  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  30.23 
 
 
272 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  30.3 
 
 
424 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1157  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.16 
 
 
381 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000112739  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.65 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  25 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  25 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.51 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  31.06 
 
 
268 aa  58.9  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  26.86 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  24.06 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  26.77 
 
 
670 aa  57  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  26.54 
 
 
646 aa  56.6  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  25.14 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  26.14 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  26.09 
 
 
301 aa  55.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.55 
 
 
572 aa  55.5  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  33.07 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  27.27 
 
 
415 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  22.49 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 
274 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  24.34 
 
 
247 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  24.86 
 
 
332 aa  52.4  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  35.45 
 
 
276 aa  52.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  25.95 
 
 
425 aa  51.2  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.03 
 
 
415 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  41.03 
 
 
270 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  23.79 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  22.59 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  27.27 
 
 
415 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.46 
 
 
304 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  24.74 
 
 
659 aa  49.7  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  30.86 
 
 
312 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  29.01 
 
 
275 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  29.94 
 
 
1498 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.46 
 
 
266 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.7 
 
 
286 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  30.86 
 
 
312 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  37.5 
 
 
269 aa  45.8  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  27.85 
 
 
568 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  29.63 
 
 
313 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  39.24 
 
 
553 aa  45.4  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.97 
 
 
265 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  34.18 
 
 
256 aa  45.4  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.03 
 
 
240 aa  45.1  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  22.16 
 
 
1478 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  23.08 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  22.16 
 
 
1478 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.6 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  23.44 
 
 
1478 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  23.44 
 
 
1478 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  23.44 
 
 
1478 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  23.44 
 
 
1478 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  23.93 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  23.44 
 
 
1478 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  23.44 
 
 
1478 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  23.44 
 
 
1478 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>