206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5904 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 313 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1363  hypothetical protein  75.08 
 
 		 321 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5255  polysaccharide deacetylase  74.35 
 
 		 321 aa  474  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.339328 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  72.82 
 
 		 308 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  70.51 
 
 		 307 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  68.01 
 
 		 313 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5147  polysaccharide deacetylase  61.09 
 
 		 300 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.472101 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0601  putative polysaccharide deacetylase  61.09 
 
 		 300 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4850  polysaccharide deacetylase  56.94 
 
 		 312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1969  polysaccharide deacetylase  58.36 
 
 		 290 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25912  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5337  polysaccharide deacetylase  58.27 
 
 		 297 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3306  polysaccharide deacetylase  60.84 
 
 		 296 aa  326  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8430  polysaccharide deacetylase  37.94 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2734  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2733  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0399  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4566  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1056  polysaccharide deacetylase  33.08 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4195  polysaccharide deacetylase  30.36 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2944  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000229991  decreased coverage  0.00000886209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3154  polysaccharide deacetylase  30.83 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0562684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4116  polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  29.79 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3184  putative polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 327 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  27.74 
 
 		 298 aa  99.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  30.18 
 
 		 364 aa  96.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  28.82 
 
 		 362 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  29.51 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  28.82 
 
 		 366 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  28.82 
 
 		 366 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  28.82 
 
 		 366 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  26.78 
 
 		 309 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  28.82 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  29.12 
 
 		 366 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  26.69 
 
 		 309 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  27.52 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5684  Chitin deacetylase  27.37 
 
 		 302 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260048  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  26.78 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  28.86 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  29.17 
 
 		 366 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  29.43 
 
 		 470 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  28.68 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  27.56 
 
 		 482 aa  86.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4388  polysaccharide deacetylase  28.42 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  27.09 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  27.74 
 
 		 470 aa  86.3  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  28.31 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  29.73 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  25.27 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  25.27 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  26.28 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  26.71 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  29.67 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  29.67 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  29.67 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  29.67 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  29.67 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3151  polysaccharide deacetylase  26.22 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  0.0334716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  22.55 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  27.01 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  28.62 
 
 		 478 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  29.35 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  28.81 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  27.8 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  27.21 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  29.33 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  28.81 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  29.35 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  26.99 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  28.01 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  27.68 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  26.99 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  26.01 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  25.68 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  27.37 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  29.73 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  26.33 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  26.39 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09327  conserved hypothetical protein  25.33 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  26.01 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.02 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  27.02 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  27.37 
 
 		 471 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>