More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5779 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
594 aa  1194    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  50.86 
 
 
607 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
597 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.77 
 
 
588 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.09 
 
 
595 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.45 
 
 
598 aa  206  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.03 
 
 
596 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.06 
 
 
631 aa  193  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.4 
 
 
634 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 
626 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.94 
 
 
624 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  26.59 
 
 
642 aa  177  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.58 
 
 
622 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  32.35 
 
 
531 aa  174  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  26.94 
 
 
581 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.9 
 
 
568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.63 
 
 
622 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.74 
 
 
647 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  26.13 
 
 
647 aa  164  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.12 
 
 
723 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0539  hypothetical protein  34.27 
 
 
287 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221333  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.18 
 
 
643 aa  160  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  29.08 
 
 
522 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.73 
 
 
658 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.12 
 
 
568 aa  157  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  25.7 
 
 
647 aa  156  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.73 
 
 
738 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  26.25 
 
 
603 aa  147  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.39 
 
 
648 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  30.21 
 
 
510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.27 
 
 
629 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.96 
 
 
664 aa  132  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  30.52 
 
 
525 aa  130  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  26.84 
 
 
518 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4488  transcriptional regulator domain protein  26.89 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309141  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  28.19 
 
 
499 aa  113  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  29.3 
 
 
543 aa  104  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  26.17 
 
 
508 aa  97.8  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  24.71 
 
 
408 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  32.75 
 
 
667 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  27.65 
 
 
515 aa  92.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1960  putative adenylate/guanylate cyclase  32.53 
 
 
317 aa  91.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  25.85 
 
 
502 aa  91.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  28.06 
 
 
686 aa  91.3  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 
652 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  26.79 
 
 
502 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  31.55 
 
 
312 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1299  hypothetical protein  26.72 
 
 
644 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2958  SARP family transcriptional regulator  26.72 
 
 
644 aa  87.8  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.30707  normal  0.853466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  29.79 
 
 
304 aa  87  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.53 
 
 
582 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  32.1 
 
 
308 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  28.17 
 
 
606 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  24.88 
 
 
527 aa  85.5  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  27.01 
 
 
522 aa  82.8  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
375 aa  82  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2731  SARP family transcriptional regulator  25.51 
 
 
644 aa  82  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  30.46 
 
 
553 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  26.11 
 
 
600 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  31.93 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493253  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  32.84 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  28.35 
 
 
521 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  29.59 
 
 
310 aa  76.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 
306 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  25.52 
 
 
521 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.59 
 
 
798 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  25.45 
 
 
784 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 
580 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 
584 aa  74.3  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.9 
 
 
757 aa  73.9  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5023  transcriptional regulator, SARP family  24.15 
 
 
623 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494336  normal  0.650955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.95 
 
 
736 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0331  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 
644 aa  71.6  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856051 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0334  integral membrane protein-like protein  25 
 
 
605 aa  71.2  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.901439  hitchhiker  0.00276659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  33.74 
 
 
680 aa  70.1  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1457  integral membrane protein-like protein  26.39 
 
 
646 aa  70.1  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60002  normal  0.0210149 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4881  hypothetical protein  26.61 
 
 
605 aa  68.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59857  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  25.17 
 
 
531 aa  68.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  24.72 
 
 
603 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0330  integral membrane protein-like protein  29.61 
 
 
608 aa  66.6  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3797  SARP family transcriptional regulator  25.89 
 
 
584 aa  66.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 
927 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 
470 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  26.4 
 
 
479 aa  64.7  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  30.95 
 
 
313 aa  64.3  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.65 
 
 
810 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  28.4 
 
 
310 aa  63.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  30.38 
 
 
425 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  23.68 
 
 
641 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.33 
 
 
769 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
543 aa  62  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  25.82 
 
 
636 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
878 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.97 
 
 
878 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  32.84 
 
 
471 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1169  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  25.34 
 
 
619 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  31.15 
 
 
1392 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0870  transcriptional regulator  22.61 
 
 
679 aa  60.1  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.918273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>