More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5357 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  100 
 
 		 297 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  44.8 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  46.46 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  41.16 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  42.21 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  44.74 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  44.74 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  44.44 
 
 		 295 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  44.74 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  39.79 
 
 		 261 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  45.54 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  39.49 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  40.37 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  39.48 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  38.49 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  40.37 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  42.68 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  40.37 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  43.8 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  40.68 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  40.13 
 
 		 298 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  43.62 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  38.78 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2178  peptidase M23B  39.63 
 
 		 244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  42.8 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3288  peptidase M23B  39.26 
 
 		 243 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3804  peptidase M23  38.89 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802385 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  43.67 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  43.67 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  43.67 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  43.67 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  43.67 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  43.67 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  43.67 
 
 		 292 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  45.78 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  40.7 
 
 		 292 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  44.1 
 
 		 292 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  41.3 
 
 		 317 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  40.42 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  41.67 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  38.73 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  42.6 
 
 		 274 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  42.15 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  40.48 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  41.41 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  40.09 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  42.29 
 
 		 236 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  38.51 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  38.72 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  41.26 
 
 		 268 aa  155  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  34.42 
 
 		 252 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  39.68 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  39.21 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  38.77 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  39.21 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  37.89 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  39.21 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.77 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  39.21 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  37.89 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  39.22 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  37.2 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  34.93 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  39.47 
 
 		 295 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  32.93 
 
 		 360 aa  148  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  36.3 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  36.3 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  37.61 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  37.61 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  39.92 
 
 		 293 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  38.84 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3262  peptidase M23B  34.59 
 
 		 331 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  37.83 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1428  peptidase M23B  39.73 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  32.76 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  34.17 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  39.3 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  37.61 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  38.01 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  37.17 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  36.86 
 
 		 322 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  36.86 
 
 		 322 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  36.86 
 
 		 322 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  38.46 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  36.86 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  37.6 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  38.3 
 
 		 239 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  36.86 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  35.97 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  36.86 
 
 		 315 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  38.82 
 
 		 284 aa  135  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  38.77 
 
 		 233 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  38.77 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  38.77 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  39.21 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  38.33 
 
 		 233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  36.44 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1451  lipoprotein NlpD, putative  35.34 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  34.06 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  35.54 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>