240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5380 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  85.04 
 
 		 253 aa  427  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  83.46 
 
 		 253 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  82.68 
 
 		 253 aa  417  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  82.28 
 
 		 253 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  82.28 
 
 		 253 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  82.28 
 
 		 253 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  73.62 
 
 		 254 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  69.29 
 
 		 366 aa  350  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  69.29 
 
 		 254 aa  348  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  68.9 
 
 		 254 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  44 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  45.6 
 
 		 267 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  39.16 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  39.47 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  38.78 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  38.78 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  38.78 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  38.93 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  38.26 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  37.07 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  38.08 
 
 		 280 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3056  hydratase/decarboxylase family protein  34.59 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2075  hydratase/decarboxylase family protein  33.33 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488863  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  34.4 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  33.6 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  35.29 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.44 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  32.84 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  29.69 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.74 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5815  hypothetical protein  32.42 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  32.4 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  33.46 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6716  hypothetical protein  32.85 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  31.6 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.84 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  28 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3930  hydratase/decarboxylase  34.8 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0554783  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  30.2 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  30.52 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  30.04 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  27.72 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.98 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3153  hydratase/decarboxylase  30.43 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2159  hydratase/decarboxylase  29.31 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2652  hydratase/decarboxylase  29.31 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  34.78 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  34.78 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  34.78 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  34.78 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  34.16 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.16 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  34.16 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  30.48 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.34 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.28 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.65 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.92 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  27.8 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.65 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  34.64 
 
 		 269 aa  62  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.9 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.63 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.29 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0650  putative hydratase  30.06 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.47 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.72 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.53 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.13 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.55 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.57 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3044  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  26.64 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0912  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.92 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.704461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5145  putative hydratase  28.82 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0494321  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  27.99 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3592  hydratase/decarboxylase  30.62 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1158  2-keto-4-pentenoate hydratase  29.63 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1061  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.63 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2420  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.52 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.97 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.5 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3446  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.68 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.19 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.61 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.12 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2889  hydratase/decarboxylase  31.25 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.05 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  30.57 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.57 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  31.9 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3129  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  31.1 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159572  normal  0.889794 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  31.1 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.81 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.85 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.08 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.13 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.21 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.32 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0200  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  26.61 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.428998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>