211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3184 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA2091  hypothetical protein  81.87 
 
 
1079 aa  1319    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  49.94 
 
 
862 aa  801    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  69.35 
 
 
870 aa  1174    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4905  hypothetical protein  59.26 
 
 
877 aa  927    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35717  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  48.91 
 
 
887 aa  757    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  81.98 
 
 
969 aa  1320    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0022  RND efflux transporter  92.93 
 
 
877 aa  1446    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2350  hypothetical protein  82.21 
 
 
877 aa  1315    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  48.34 
 
 
868 aa  734    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  45.97 
 
 
887 aa  701    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  50.29 
 
 
862 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5501  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  93.16 
 
 
877 aa  1527    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921684  normal  0.0209878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  70.95 
 
 
871 aa  1146    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3569  hypothetical protein  50 
 
 
868 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  50.46 
 
 
872 aa  772    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  60.46 
 
 
908 aa  959    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5183  RND efflux transporter  93.84 
 
 
877 aa  1540    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3184  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  100 
 
 
877 aa  1738    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4559  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  94.18 
 
 
877 aa  1538    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.151597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4948  RND efflux transporter  92.93 
 
 
877 aa  1522    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5676  RND efflux transporter  93.84 
 
 
877 aa  1540    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  44.38 
 
 
882 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  48.61 
 
 
868 aa  779    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1119  hypothetical protein  81.87 
 
 
1083 aa  1317    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.143143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3246  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  48.79 
 
 
882 aa  698    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689074 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1399  hypothetical protein  81.87 
 
 
877 aa  1320    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3264  hypothetical protein  81.98 
 
 
877 aa  1322    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3151  hypothetical protein  81.98 
 
 
877 aa  1322    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2383  hypothetical protein  81.87 
 
 
877 aa  1320    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  44.48 
 
 
882 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7033  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  71.3 
 
 
871 aa  1172    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.642403  decreased coverage  0.0000000105164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  44.34 
 
 
895 aa  631  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  44.06 
 
 
882 aa  631  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  43.86 
 
 
882 aa  626  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  47.5 
 
 
669 aa  549  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  38.16 
 
 
864 aa  486  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  33.99 
 
 
901 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  35.36 
 
 
889 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1777  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  35.33 
 
 
900 aa  389  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2118  hypothetical protein  35.34 
 
 
879 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  32.51 
 
 
890 aa  378  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1044  RND efflux transporter  37.57 
 
 
858 aa  378  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  33.18 
 
 
901 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20740  hypothetical protein  36.68 
 
 
864 aa  360  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  31.69 
 
 
884 aa  348  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  26.7 
 
 
1128 aa  262  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  28.77 
 
 
767 aa  258  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.45 
 
 
886 aa  247  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  27.45 
 
 
892 aa  246  9e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.04 
 
 
883 aa  213  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  26.61 
 
 
972 aa  212  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  25.76 
 
 
920 aa  204  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.36 
 
 
883 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  25.62 
 
 
910 aa  203  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  27.21 
 
 
899 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  26.46 
 
 
893 aa  187  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.62 
 
 
1045 aa  167  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  26.73 
 
 
906 aa  127  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  25.33 
 
 
849 aa  89.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  34.23 
 
 
845 aa  79  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  25.15 
 
 
847 aa  77.8  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  32.43 
 
 
839 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  21.51 
 
 
1274 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  24.76 
 
 
1146 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  23.09 
 
 
1287 aa  65.1  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  31.01 
 
 
1359 aa  64.7  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  27.78 
 
 
1011 aa  64.3  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  27.46 
 
 
1013 aa  62.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0221  RND efflux transporter  20.38 
 
 
771 aa  62.4  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.822518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  33.15 
 
 
730 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  24.53 
 
 
783 aa  62  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0437  hypothetical protein  24.48 
 
 
813 aa  61.2  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  39 
 
 
782 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  29.2 
 
 
1077 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  29.46 
 
 
789 aa  59.7  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  27.32 
 
 
805 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0333  hypothetical protein  23.1 
 
 
840 aa  58.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1418  integral membrane efflux protein  29.7 
 
 
1004 aa  58.2  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.133612  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.63 
 
 
1226 aa  58.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4286  RND efflux transporter  25.42 
 
 
845 aa  57.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  24.34 
 
 
898 aa  57  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.78 
 
 
1172 aa  57.4  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  28.32 
 
 
1062 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  26.17 
 
 
816 aa  57.4  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  28.32 
 
 
1062 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0338  hypothetical protein  22.76 
 
 
843 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  28.42 
 
 
681 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0341  hypothetical protein  22.76 
 
 
847 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.1938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  27.98 
 
 
802 aa  55.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  28.42 
 
 
1040 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.15 
 
 
798 aa  56.2  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  29.26 
 
 
747 aa  55.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  28.42 
 
 
1028 aa  55.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  32.37 
 
 
843 aa  55.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0331  hypothetical protein  22.41 
 
 
835 aa  55.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  26.6 
 
 
840 aa  55.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  30.83 
 
 
967 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4274  exporters of the RND superfamily  26.6 
 
 
846 aa  55.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  25.68 
 
 
974 aa  54.7  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  22.84 
 
 
713 aa  54.7  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>